Basic Information

Symbol
MSN
RNA class
mRNA
Alias
Moesin Membrane-Organizing Extension Spike Protein Epididymis Luminal Protein 70 HEL70 IMD50
Location (GRCh38)
X:65588377-65741936
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002444.3
Sequence length
3960.0 nt
GC content
0.5025

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1295.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1367.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1010.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((((((.(((((((....((((.(((..((((((.....).)))))....))).))))(((.((..(((((.((...)).)))))..)).)))))))))).((((((.......))).)))..((((((...((((.....(((((((((((.((((....((.((....)).))......((((((((.....((((((((...((((.((.((((((((((((((((........))))))....(((((((.((...(((....))).)).))))))).....(((((((((.((((.((((((((...(((.((((((((.(((((.(((..(((((((((((((((..((...........)).))))).....((((((((((((((((((.(((.....))).)))...))))))))...(((((.(((((((.(((((((((((.......))).))))..........((((..((((((.......)))))))))).((((((..............((((((((((.(((((((.(.((((((((((.((.((((((((((..........((.(((((......))))))).....(((((((....)))))))(((...((((....))))...))))))).))))))........)).))).)))))))..).))))).)))))))).))))))))))........)))).))))))))))))...))))))).((((((..(((((......)))))..)))))).(((((((((....)))).))))).....(((..((((.(((((..(((((((((((.((((((((((((.((((.......)))).((((.(((((((..(((((...((......))....)))))......(((((((........(((((((((...(((((((..........)))))))...((((((((((..((((((((......(((....))).....(((..(((((..(((.(((((.((((.(...((((.......))))).)))))))))))).))).)).))).((((((((((..(((((((.....((....))....((.(((........))).))((((.((((((......((((((((((.((((((...(((((((((((((...(((..((.(((....(((((((.((((((...(((((((.((((((((...((((..((((((..((((...(.(((.((.((((((((.(.(.((((((((((((.....((((..(.((.(((....)))..)).)..))))(((....)))(((((....(((........))).....))))).((((((((......))))))))((((.((...........(((......)))(((........))).(((((...)))))..((((((.....))))))))))))...((((((((....(((((((...((((.(((((((((.((((((.((((((((((...((((((((((((..(((....(((.(...((((((((((.....))))..))))))..((((((.......)))))).).)))(((..((((..((((....(((((((.(((((((((..((((((.......((((((((.((((((((..((((.(((((.((.((((.((((((.........((((....))))((((((.......))))))..(((((....))))).....((((......))))((...((.((((((((((((((.((.(..(((.(.(((.(.............).))).))))..).)))))))((((.........(((((((.(((......(((((...((((.((((.((..((.....(((((.......))))).....)).)).))))......))))....)))))......)))...)))))))..(((........).)).)))))))).))))).)).))......(.(((((((((.((((.....((((..(((((((..............))))...)))..)))).....)))).)(((((((((................)))))))))......)))))))).)........))))))..)))))).))))).))))..........((....)).......)))))))).))))).)))..))).))).....)))))))))..)))))))))))...)))).)))..))).)))))))))))).))))).....))).)).)))).)).))((.((((((.((((..(((((((((.....((((((((....)))))))).(((((.(.....((((.((.((((...(((((((((((.....))))))).))))..)))))).)))).....).)))))...)))))))))....)))))))))).)))))))))..))))))))))).....))))(((.((((....(((.(((..(((((.(((((.......))))))))))))).))))))))))))))......((((.(((((.(((....))).))))).))))...((((((.((......((((((...........))))))......)))))))).....))))))))))))).).)))................))))).))))).)...))))...)).))))..)))).))))))))..........))))))))))).....((..((((.(((.(((.((((.((((((.((.........(((.((((((((...(.....)...))))))...)).)))..........))))).))).)))).)))))).))))..))(((.(((.(((..((((((.(((..(((.....((((((((((((((((((((........)))))))..)))))......)))).)).))......))).)))))))))..))).))))))...(((((.....(((.....)))....)))))..........))))))))).))).))..)))....((((.(((((((((..((((..(((.((......)).)))..))))...((((.....))))..((((((.(.((((.(.......).)))).).))))))...)))))))))))))................((((((.......)))))).....)))))))))))))))))))....))))))))))....))))))...))))......((.(((........))).))))))))).))))...))))))..))))))))...)))).)))))).((((.....((((((.........................((((((......(((((((((((((...))))))..........)))))))....)))))).....(((((((.......))))))).))))))....))))............)))))))))))))))).........))))))))))).))))))))...))))...((((((....((((........)))).))))))......(((.....))).....))))))))))).........))))).))))...)))))))))))))..)))....((((.....))))(((.(((((.(((((...)))))..)))))..)))..))))).)))))))).)))...)))))..))).)))).)))))))))((((.(((((((.....)))))))...)))).....))))))))))))))))...))))))))))))))))................)))).)))))))).))).......))))......)))))).......))))))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{.{({(((((((((((((((.(((((((((.(((,.((((((.....),})))).}..))).)))}((({(,{.(((((.({...}).))))){{{|.,|,.........}}}|...{,,{{(((,((...},||.)).,},))})}))}))...,}))))).))))))||,((....}}.}}......((((((((.....(((({(((...((((.((.((((((((((((((({.,,..{{.||||||{...(((((((,({...,,.....,),.)).))))))).....(((((((((.((((.((((((((...(((.((((((((.(((((.(((..((((((((({(((((..{(...........}}.))))).....(((((((((((((((,((,(((.....))).))}...))))))))..,(((((.(((((((.(((((((({,(,,.....))).)))),,{,,,,{,.((((..((((((.......))))))))))..,{{,,.,,,,},....,..((((((((((.(((((((.(.((((((((((.((.((((((((((......,{{,((,(((((......)))))))}},..(((((((....)))))))(((...((((....))))...))))))),,)))))........)).))).))))))).,..))))).)))))))).))))}))}|,....,.,,)))).)))))))})))}}}}))))))).((((((..(((((......)))))..)))))).(((((((({....}))},)))))....,(((..((((.(((((..(((((((((((.((((((((((((.((((.......)))).((((.(((((((..(((((...{,.,{{..,}.,}}))))){{{,..{(({....,}.}}}}((((((((({,.(((((((..........)))))))...((((((((((..((((((((......(((....))).....{{{..(((((..(({{(((((.((((.(...((((.......))))).)))))))))))).))).)).}}}.((((((((({..,,,(((,...}}|,{{{{||{{{{((.,{(,,..{{{.|||{|}((((.((((((......((((((((({.((((((...(((((((((((((................((({{,.((,({{(,((.(({{({(((((,,((,,.,,.{({..,,,.||..|,.,|}}}}}|,.,..((({..{{{((({,,.{{{||((((,{,..{{{{.,(,{(.{{(....)}),|)},},,)}}|(((....)))(((((....(((........))).....))))}.((((((((......))))))))((((.((,..........({(...,,,||}(((........))).(((((...)))))..((((((.....)))))))))))}...,..{,{((.({,,({(((((((((((((.(((..,.(((((((.((((.{..({,((...((((,(((((.{,((((((((.....((((((((((.....)))}.,))))))..((((((.......)))))).{(((((((..{{{,..(((((((((((((,.{({,{((,,,.}|,|.|.}}..}}}||.(((((.((((((((..((((.(((((.((,{(((.((((((...,{,,.,((((....})}}((((((.......))))))..(((((,..,|}}||..{{{({((,,.,..|,||((...{(.((((,((({,{{{{.||.|,,|{{.,.(((.{..{..........|.|||{||,,....,,,}))))))|.........{{,,((({,(({......,,||}.}}||..||(({.....}}},..(((((.......))))).....,}})}}))}}..{{{{.,||{...,,,,,......,,,...,))),,)}}}..........}.))})),})))).))))}.},.|||{,...{,{{((((((({{({{.....{{{{..{{,{{{{..............)))}...,},.,)))).....}))),)|((((((((................)))))))))..}}}})))))))},.....,...))))))..)))))).))))).))))...,,.....{{....}}.......)))))))).)))))..{((((...{{,{.(((({,({{|,,.,))),)))))))}..,))))},,,{{{{(({..{{{{(((,...))))}}...,,}}}}},|{{{{{...({((((((.((((,{((({{(((,..,.,((((((({....})))))))..,,|,......,(((({((,((((...(((((((((((.....))))))).))))..))))||,,|||{{{{{|.,,,},),}))))})}))...,|}}}|||||(({((({,{{{..((((((((({,,...{{{,.(((.{(({....(((.(({,.(((((.(((((.......))))))))))))).)))}})})}},,{{......,,,,.,,|||}|||.,,,|||{|,,,,.,))))).)))))))))...,,,|||{{{....,,,,,,.}}))))))}}})))})))))..,|,|}},,,,..))|}||||||...}}}..}}},,..,}}})))})))))..))))))}}))}.))))))))))))))))}},..........,{{{{{{.|{{,,...}))}})}},|||,.......})))))})}{{((((..{{{{.{((((.....}}))}||{{{{{,..,.,...,,},},..))))},}|)))).,.))))}}...)))))})))}..)))).}.)))).))))))).,.))).))))))))))))).||{{((((((((((((........)))))))..)))))......||||{{{{,,,.....{,(((((.,.(((,{({{{{{{,|{.,........}}.)))).))),})).,))))),},.......}).)}}}}},.})}}}},||||,...}}}),},}})))))}))),}}}}}}},.,..,,,|,....,,))})))),.},,)))))})))),||||{,(,((((.{......,|,|||}.}.||||}},,|||..,}},},}}}))),,.)})),.,}}.||||||}......),))).}),..)))))))))))))))))}}.,,,))))))))))....))))))...))))}}},}}|,.,||,......,),)}))),)))))}})))}..,)))))..))))))))...)))),,))))),(((({{{{.((((((......................,{|{(((((......((((((({{((((...}}}}))..........)))))))..,.))))))}}...((((((({.....,))))))).))))))...,))}),}}}}..,,,,.,,,,,}}}}},}))))}}}}}}...))))))))))).))))))))...))))...((((((....((((........)))).)))))).,,...{{|,....}}}.....))))))))))).........))))).))))...)))))))))))))..))),...{{{{,,...||||{|{.,((({{({,{,.,,})}},,}))))}..,,...))))).)))))))).)))...))))}.,))).)))).))))))))).,,,.(((,,,|}}.}})))))))..}),,))}}.}))))))))))))))))...)))})))))))))))).......,,,.......((((.((((....))))..)))).,..,......,}.,........,,})))))))).....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002444.3 NCBI
GGCUCUUUCCUGGGUGGGGUUUGUGAAGUCGUGGCCCGUUAGCAGGAAG… 3960 nt 0.5025
Summary

Moesin (for membrane-organizing extension spike protein) is a member of the ERM family which includes ezrin and radixin. ERM proteins appear to function as cross-linkers between plasma membranes and actin-based cytoskeletons. Moesin is localized to filopodia and other membranous protrusions that are important for cell-cell recognition and signaling and for cell movement. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.