Basic Information

Symbol
MSRB3
RNA class
mRNA
Alias
Methionine Sulfoxide Reductase B3 Methionine-R-Sulfoxide Reductase B3 DKFZp686C1178 EC 1.8.4.12 FLJ36866 DFNB74 Methionine-R-Sulfoxide Reductase B3, Mitochondrial Deafness, Autosomal Recessive 74 EC 1.8.4.14 MsrB3
Location (GRCh38)
12:65278643-65491430
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001031679.3
Sequence length
4377.0 nt
GC content
0.4409

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1338.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1425.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 970.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001031679.3 NCBI
AUGCCUCCCGCCGCCCCGUCCGUCGCCCGGAGCCGGGGAGGGAGGGAGC… 4377 nt 0.4409
NM_001193460.2 NCBI
AUGCCUCCCGCCGCCCCGUCCGUCGCCCGGAGCCGGGGAGGGAGGGAGC… 4541 nt 0.4440
NM_001193461.2 NCBI
AUUCUGCGCCUGCUGCGCCCCCUCGGCCACCUGCGGGGACAGCCCCUGC… 4309 nt 0.4351
NM_198080.4 NCBI
AUGCCUCCCGCCGCCCCGUCCGUCGCCCGGAGCCGGGGAGGGAGGGAGC… 4250 nt 0.4388
Summary

The protein encoded by this gene catalyzes the reduction of methionine sulfoxide to methionine. This enzyme acts as a monomer and requires zinc as a cofactor. Several transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. One of the isoforms localizes to mitochondria while the other localizes to endoplasmic reticula. [provided by RefSeq, Jul 2010]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MSRB3 was downregulated during short-term weight loss in subcutaneous adipose tissue of obese participants [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].