Basic Information

Symbol
ARC
RNA class
mRNA
Alias
Activity Regulated Cytoskeleton Associated Protein Arg3.1 KIAA0278 Activity-Regulated Cytoskeleton-Associated Protein Activity-Regulated Gene 3.1 Protein Homolog ARC/ARG3.1 HArc
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_015193.5
Sequence length
2950.0 nt
GC content
0.6685

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1369.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1408.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 622.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((((((.((((.((((...(((.((....)).)))..))))))))...))))))).(((...((((((......))))))..)))((..(((...((((((((..(((((...(((((((...((((((...((((.(((((((.((.(((((...(((((((((((.((((((((((((..(((((.(..((.((...........)).))..).)))).)..))))))))))))..((((.....))))..))))))))))))))))))..(((..(((((.(((.(((..((((...........))))..))).))).)))))..)))((((((..((((........))))..))))))..((..((((.((((((((((...(((.(((.(((((..........)))))...))).)))...))))).)))))))))..))........))))))).....)))).....))))))))))))).)))))..)))).....))))...)))..)).(((((....((((.(.((....)).).))))(((((((......((..((.((.((((((((((.((((((........((.((((((........((((((.(.((..(((((((.((..(((((((((((((((((((.(......((((.(((((....)))))..))))..(((......)))).))))))))))..)))....((((((((((..(((..(((((((((((....)))(((((.((((((((.......))..)))).)).)))))....))))))))...))).))))(((((((.(((((....((((((((((.(((.......(((((((.....((((((..((.((((((((((.(((((((.((((((((((.((((((.(((.....)))...(((((...((.((((.....)))).)).))))).((((((((((.....(((((......))))).....)))).))))))...((((((......)))))).((....))...((((((....))))))((((((((.....((.(..((((..((((..(((.((((((.......)))))).)))..))))..))))..).))...)))).).))).)).)).)).)))))))....(((((........))))).((((.((.((((((((((((...((.(((((....(.(((((........))))).)))))).)).))))))))).))))).)))).(.((((((...)))))).)(((((((....))))).))....(((((((...))).))))(((........))).(((((.(........))))))...((((.......)))).)))))))))))))).)))))))).))).))).....))))))).(((((((((.....((((((((((((((.((...((((((((((((((((....(((((((((.((((((.....)))).)).(((((((((....)))).........)))))....)))))))))(((.....)))..(((((((.(.(((((............(((((((..(((((......((((((((...............)).))))))...)))))...(((.((((((......(((..........)))(((.(((((((((............))))))))).))).((((((...)))).))..((((.((((...)))))))).)))))).)))...(((....))))))))))....((((((.((.(((((((((((((..(((...))).)))((((((((.......(((((.....))))))))))))).......)))).).))))))).((((((...))))))....))))))(((((.(((((((((((((((((.((((.....((((((((((..(((((((((.(.(((((.((((.((((((.(..((.(((((((...)))).))).)).)))).))).))))..))))).)...))))))))).........(((((((......)))))))..........))))))).))))))).)))))))...((...)).....).))))))))))))))((((.....)))).(((((.((.((((((...)))))).)))))).)..(((....)))))))).))))))))...(((((((((...(((((.(((.(.((((....))))).))))))))(((.(((((((((.(.((.(..((((..........)))))))))))))).))))))(((........))).(((...(((((.((.(.((((((((((..........))))))....))))))))))))..)))..))))))))))))).))))).....((((....))))(((((....)))))..)))))))..))))))))).))))))).....(((((....((((((.(((....))).))))))..))))).((((........))))....((((((....)))))))))))))))..(((((((((((.......))))))))))))))))))))).))).)))))..)))))))))))))........((((((....)))).)).(((((((..........((((((((.....((((........((......)).......)))).....))))))))((((((((((((...)))))))))))))))))))...))))))....)).))).).)))..)).))))))))))))))).......)))))).......)))))))))))))).)))))))))..))))).((((((.((((.....)))).)))))).........))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.(((((((.((((.((((...(((.((....)).)))..))))}})),.,))))))){((({{{((((((......)))|||{{{{,((,.(((...((((((((..(((((...(((((((...((((((...((((.(((((((.((.(((((...(((((((((((.((((((((((((..(((((.{..((.((.{.,....},.)).))..}.)))).,..))))))))))))..((((.....))))..))))))))))))))))))..((({.(((((.(((.(((..((((...........))))..))).))).)))))}.)))((((((..((((........))))..))))))..((..((((.((((((((((...(((.(((.((((((......}..}))))...))).)))...))))).)))))))))..))........))))))).....)))).....))))))))))))).)))))..)))).....))))...)))..})|||||||,..|{|||,,|,,|||}|,|||||||((((({.,...|||||((,((,((((((((((.((((((..,....,((.((((((......,.((((((.(.((..((({(((.({..((((((({{((((((((((.{...,.,((((.(((((....)))))..)))).,(((......)))}.))))))))))..},,...,((((((((((..(({,.(((((((((((....)))(((((.(((((({(.,,....)).,)))).)).)))))....)))))))).}.))).})))(((((((.(((({....((((((((((.(((.......(((((((.....((((((..((.((((((((((.(((((((.((({{,((((,(({{{|.|.{||,...,,...{{{{{,,,((,((({.....||||,||.}}}},.((((((((((.....(((((......))))).....))))}}))))).,.((((((......)))))),((....}}...((((((....))))))|||{(|||....}||}|..((((..((((..(((.((((((.......)))))).)))..))))..))))..},|}..{|||}{|..|||}}.,,.},})),)),)}}|.(((((........))))}.((((.((.((((((((((((..,{{.(((((....,.(((((........))))).}))))).)).))))))))).))))).)))).(|((((({...)))))),)||(((((....))))).}}.,{.(((((((...))).))))|||,.......}}}.(((((.(........)))))).,.((((.......)))).)))))))))))))},)))))))).))).))).....))))))}.(((((((((,.,..|(((((((((((((.((...((((((({((((((((.,,.(((((((((,||{{{{.,,||)))).)).{,|{{|{||.,||}}}},.....,}))))}),...)))))))))|{,...{{|||{{{{,,,,,,.}|||||}...........({(((((.||((((,.....((((((((...............,,.})))))...,}}}}...,{{.{(((((......{{{,,.......,|,|(((.(((((((((...,........))))))))).))).{|(({{.,.))||.|,..((((.((((...)))))))).}}}||}.}||,,,{{{....|||}}|||}||...((((((.((.((((({((((,,,..(((...}}|,.|,((((((((.......(((((.....))))))))))))),.,,...)))).).)))))})|((((((...))))))....))))))(((((.(((((((((((((((((.((((.....((((((((((..(((((((((.{.(((((.((((.((((((.{..((.(((((((...)))).))).)).}))).))).))))..))))).}...))))))))).........(((((((......)))))))........}.)))))))}})))))).)))))))...{{...}}.....).))))))))))))))((((.....)))).,((((.((.((((((...)))))).)))))).}..{{{...,)))})}}}.})))))))...(((((((((..,((({(((((.,{((((..({((,,..)))),)))}|{.(((((((((.(.((.{..((((.{,.....,.))))))))))))))},))},)||||,,|.,....|.{{{...(((((.((.(.{(((((((((..........))))))....))))))))))))..)))}.))))))))))))).)))))...,,,((({{,.,,,)|||||,...}}}}}..)))))))..))))))))}.})))))}..|,.(((((..,.((((((.(((....))).)))))).,))))).((({...,}}}.}}}|....((((((....)))))))))))))))..(((((((((((.......))))))))))))))))))))).))).)))))..)))))))}))))).,......{(((((....)))).)}.(((((({..........{(((((((.....((((...,....((......)).,.,,..)))).....)))))))|((((((((((((...)))))))))))))))))))..,))))))....)).))).).)))..)),,)))))))))))))).....,,)))))).......)))))))))))))),}}))..{{{{{...{{{({,,,,,|||{...}}))),.}}||||.....,,,.}}).......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCAGAGCUCGGGCGCGGCGUCCUCCCUCCGCAGCAGCCGAGCCGGACCU… 3200 nt 0.6688
GCAGAGCUCGGGCGCGGCGUCCUCCCUCCGCAGCAGCCGAGCCGGACCU… 2950 nt 0.6685
Summary

Enables mRNA binding activity and structural molecule activity. Involved in cell migration; cytoskeleton organization; and regulation of cell morphogenesis. Located in cytoplasm and plasma membrane. Part of virus-like capsid. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine exposure alters microRNA expression in the nucleus accumbens, identifying 45 known and two novel METH-responsive miRNAs [Zhu et al. DOI:10.002/jnr.23605].