Basic Information

Symbol
MTDH
RNA class
mRNA
Alias
Metadherin LYRIC AEG-1 3D3 Lysine-Rich CEACAM1 Co-Isolated Protein Astrocyte Elevated Gene-1 Protein Metastasis Adhesion Protein Astrocyte Elevated Gene 1 Protein LYRIC 3D3/LYRIC AEG1 LYRIC/3D3
Location (GRCh38)
8:97644013-97730260
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_178812.4
Sequence length
7662.0 nt
GC content
0.4220

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2454.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2592.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1986.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001363136.1 NCBI
AAGCCGCCAUUGUUCCGCCGAGGGAGGACAGCGGGGCCUGGCGCUGGCG… 7596 nt 0.4226
NM_001363137.1 NCBI
AAGCCGCCAUUGUUCCGCCGAGGGAGGACAGCGGGGCCUGGCGCUGGCG… 7752 nt 0.4221
NM_001363138.1 NCBI
AAGCCGCCAUUGUUCCGCCGAGGGAGGACAGCGGGGCCUGGCGCUGGCG… 7563 nt 0.4217
NM_001363139.1 NCBI
AAGCCGCCAUUGUUCCGCCGAGGGAGGACAGCGGGGCCUGGCGCUGGCG… 7497 nt 0.4223
NM_178812.4 NCBI
AAGCCGCCAUUGUUCCGCCGAGGGAGGACAGCGGGGCCUGGCGCUGGCG… 7662 nt 0.4220
Summary

Enables NF-kappaB binding activity; double-stranded RNA binding activity; and transcription coactivator activity. Involved in several processes, including lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; positive regulation of intracellular signal transduction; and regulation of DNA-templated transcription. Located in endoplasmic reticulum; nuclear lumen; and perinuclear region of cytoplasm. Implicated in hepatocellular carcinoma. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic cocaine treatment increased the synaptic protein level of the MTDH to 142% in striatal post-synaptic densities, with its 3' UTR being targeted by multiple cocaine-regulated miRNAs including miR-183, the miR-8 family, miR-16, miR-32, miR-33, miR-130b, and miR-153 [Eipper-Mains et al. DOI:10.1261/Rna.2775511].