Basic Information

Symbol
MTMR12
RNA class
mRNA
Alias
Myotubularin Related Protein 12 3-PAP KIAA1682 PIP3AP Phosphatidylinositol 3 Phosphate 3-Phosphatase Adapter Subunit Phosphatidylinositol-3-Phosphate Associated Protein Inactive Phosphatidylinositol 3-Phosphatase 12 Myotubularin-Related Protein 12 3-Phosphatase Adapter Protein FLJ20476 3PAP Phosphatidylinositol-3 Phosphate 3-Phosphatase Adaptor Subunit 3-Phosphatase Adapter Subunit
Location (GRCh38)
5:32226994-32313013
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001040446.3
Sequence length
5116.0 nt
GC content
0.4349

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1568.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1662.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 964.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001040446.3 NCBI
GGAGCCCCAGCCGCUAGUGCUGGUGGCCGCCGCUGCUGCCCCAGCUGGA… 5116 nt 0.4349
NM_001294343.2 NCBI
GGAGCCCCAGCCGCUAGUGCUGGUGGCCGCCGCUGCUGCCCCAGCUGGA… 4954 nt 0.4334
NM_001294344.2 NCBI
GGAGCCCCAGCCGCUAGUGCUGGUGGCCGCCGCUGCUGCCCCAGCUGGA… 4786 nt 0.4336
Summary

Phosphatidylinositide 3-kinase-derived membrane-anchored phosphatidylinositides, such as phosphatidylinositol 3-phosphate (PtdIns(3)P), regulate diverse cellular processes. The protein encoded by this gene functions as an adaptor subunit in a complex with an active PtdIns(3)P 3-phosphatase. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2014]

Forensic Context

A study in porcine skin demonstrated that the MTMR12 was significantly decreased in response to sulfur mustard exposure at 7 days postexposure [Price et al. DOI:10.080/15569520903097754].