Basic Information

Symbol
MTMR14
RNA class
mRNA
Alias
Myotubularin Related Protein 14 C3orf29 HJumpy Phosphatidylinositol-3,5-Bisphosphate 3-Phosphatase MTMR14 Phosphatidylinositol-3-Phosphate Phosphatase NS5ATP4ABP1 FLJ22405 FLJ90311 HEDTP HCV NS5A-Transactivated Protein 4 Splice Variant A-Binding Protein 1 Egg-Derived Tyrosine Phosphatase Homolog (Drosophila) Egg-Derived Tyrosine Phosphatase Homolog Chromosome 3 Open Reading Frame 29 Myotubularin-Related Protein 14 EC 3.1.3.95 Jumpy
Location (GRCh38)
3:9649433-9702393
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001077525.3
Sequence length
2452.0 nt
GC content
0.5591

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-947.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -991.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 729.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.((((((((....((.(((((((((((((.((((....)))).))))).)))((((((((((((((((((((.((((..(((((((((((((((...((((((((((((((((.((((((((((((((((((..((((((.......).))))).))))))))))..))).))))).)))..((((........)))))))...)).))))))))...))))))))).......)))))).((((((..((..((((.(.(((....)))).))))..)).))))))(((.(((((((((((((.((((((((..((....)).)))))))).....)))))))..)))))))))......(((((((((((........(((((((.((.((((((((.(..(((...)))....(((((((((.(.(((...(.(((((...((((((.....((((((((...(((.....))).....))))))))...))))))....)))))).)))).)))))))))..).)))))))))).)))))))........)))))))))))(((((((((..((.....(((.(((((.(((((..((((((((....(((((.((...((((((((((......(((.((((((((...))))))))..))).......)))))))))).....))))))).......)))))))).....((((((((....((.(((((((((.(((((...(((..((.(((......))).))))).(((.....))))))))))))))))).)).))))))))(((..(((((.(((.((.....(((.(((......((.(((((.....(((.(((..(((((((.......(((....)))........))).))))..)))..))).)))))))))))))..((((.(((.(((((((((((....)))..)))))))).)))...))))............(((((...(((((....)))))...))))).((((((.......((((.....))))...)))))).)).))).)))))..))).....))))).)))))))))))))))))))..((((((((((...((((..........).)))...))))))).))).((((((.......(((((((.......((((((.....((((((.((((((..(((((((((.((..(((((((((.....)))))))))(((((((....))))))).....(((((((((.((....)).)))....((((.((.((((...(((((.((..(((.(((.(((.((((((......)))).........(((((..(((.......)))..))))))).))).))).))).)))))))))))))))))..)))).))..(((((......))))).((((((....)))))).)).))))))))))))))).(((((((......))).))))((((((.(((...))).)))))).......))))))...)))))))))))))......))))))(((((.(((((.......))))).)))))..)))))))...))))))))...........(((((((((........)))))))))...)).)))))))((((((((.(............).))))).)))))))))).((((((.((((((((.((((...((.(((((((((..(((...((((.(((((((.....(((((((((((((.((((...(((((..((((((((.............))).))).........))..)))))(((((((((..((((.........)))))))))))))..((((((..((((.....)))))))))).)))).)))).((((((..((((....))))..))))))(((((((((......)))..))))))(((...))).(((((.(((((.((.(...(((...(((....)))..)))...).)))))))))))).......))))))))).((((.(((((....))))).))))......((((....)))).((((((((.......((((((((((........))))).....((((.......))))((((......))))................(((((....)))))((((.(....).)))))))))...))))))))))))))).))))...))).(((((((.....((((((...........))))))......))))))).....((((((.(((((.(((......)))))))).).))))).))))))))))).)))).)))))))).))))))..((((.((.......))))))))))))))))).............(((((.....)))))...))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.,.(((((.(((,,((((.(((((....))).)).))))))))..)))))...{(((((.{{.((((((((,...(((((...(((((((((((((...((((((((((((((((.((((((((((((((((((..(((((,.{....}}.))))).))))))))))..))),})))).)))..((((,,...,,.)))))))...)).))))))))...))))))))).(((((((((((((({{{{{{(({..(({{(({((({{{,{({|(((((....))))).,{{{.(((((((((((((.((((((((..,{....,}.)))))))).....)))))))..))))))}}}.,,,.,(((((((((((........(((((((.((.((((((((.{..(({...}))....(((((((((.(,{{(,..{.(((((,||{(((((.|...(((({((({,,{{(....,||}..,..})||}}||...}))))}..,,))))),.}))),)))))))))..}.)))))))))).))))))).....,,.}))))))))))|((((((((..,{.,.,.(((.(((((.(((((,.(((((((({,..((({(.,|...((((((((((.....,(({.{(((((((...}))))))}..})).......)))))))))).....}}))))).....}.)))))))).,...((((((({....({.{(((((({{{(((((,..|{|.,{(|{{{...,}.)))}}},,..|||,..,,))))))))))))))))),)),))))))))(((.,{(({(.(({.((.....||,,{{{......,{,{{{(|,,,,,.,|||||,.{{(({((.......(((....|||,,....,.}||,||}}..,}}.})))}}}))}}}))))),.,|{||.(((.(((((((((((....))),.}))))))).)))..,||||.......,,,..(((((...(((((....)))))...))))).{{{{|{....,,,((((...,|))}}|||}})))|,|},))),)}||,,.))}.....))))}.)))))))}||}}}}}}}},..,,,(((((((...((({.,........).)))...))))))),|||....((((((..({((((.((...((........)).,.)).)))).)}.))))))..}})))))}..||||{((((({...,,,))))}{(((((((....)))))))}....,{{{{{{{({{(,,,,{{,||{{{,,,...}}))}||||{,|{{|||{||||||{||||||{|}(((,({,{(((,.,,.({(((((..(((({{(.({.((({({(,(({{{..,,,|,,,||,|{{{{{{(,,,,{{{{..}},,.,||}||((({(((((......))))))))}}..,|,.{((((..{{({{((((({.{{{{,,{(((((((......))).))},((((((.(((...))).)))))).,,,.,,|||{|||||||.,,,||,..,..,),)))})))},}))}}|}}.,,||.,,.|||}|||||||,,|},}},,}},)))))})),)},))})...(((((((((........)))))))))..,},}},}},}}|||{|{{{.,....,.......}.))))}.}}}.)))))))).)))).)))))|,..,.....,||}})).,))))))),...}))),|}|})||}},,})}|.,,}||}))),,,})),}.)))))))})},)))},)})}})}},}}})}},,}}))))....{|{...,)))(((((((((..((((.........))))))))))))).))))))))))))))).{(((((((.....))))).))}(((((((...(((((..((((((.({((....)).,,..,.)))))))))))((((((,..{{..(((((.(((((.{(,{...(((...(((....)))..)))...),}))))))))))).}}..,...)))))),,((({.(((((....))))),))))......((((((,{(((((((((.....))))..)))))|((((........))))}..,,........),.)))))))))))))...,,))))..)))))......(((({....})))))))))))).,}..{(((....)))))))))}|,{(((((((((((.,..,,.,,,{,{{.,(({,(((,.,|||,,|,.{{{{{(((((((.(((((((({...(((((..((((((...)))}),)))))...)))))))))....))))))}.,....})))),})})))),}.)),})}..})}...)))))))}.})))).))}.............(((((,...,)))))..,))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001400536.1 NCBI
AGGUUCUAGUGUCGGAGUUGGGUGCAGGCAGGUGCCAUGGGCCCGCUUG… 1795 nt 0.5565
NM_001400537.1 NCBI
AGGUUCUAGUGUCGGAGUUGGGUGCAGGCAGGUGCCAUGGGCCCGCUUG… 1892 nt 0.5613
NM_001400538.1 NCBI
AGGUUCUAGUGUCGGAGUUGGGUGCAGGCAGGUGCCAUGGGCCCGCUUG… 2301 nt 0.5615
NM_001400539.1 NCBI
AGGUUCUAGUGUCGGAGUUGGGUGCAGGCAGGUGCCAUGGGCCCGCUUG… 2159 nt 0.5572
NM_001400540.1 NCBI
AGGUUCUAGUGUCGGAGUUGGGUGCAGGCAGGUGCCAUGGGCCCGCUUG… 2187 nt 0.5583
NM_001400541.1 NCBI
AGGUUCUAGUGUCGGAGUUGGGUGCAGGCAGGUGCCAUGGGCCCGCUUG… 2220 nt 0.5590
NM_001400542.1 NCBI
AGGUUCUAGUGUCGGAGUUGGGUGCAGGCAGGUGCCAUGGGCCCGCUUG… 2422 nt 0.5582
NM_001400543.1 NCBI
AGGUUCUAGUGUCGGAGUUGGGUGCAGGCAGGUGCCAUGGGCCCGCUUG… 1981 nt 0.5628
NM_001400544.1 NCBI
AGGUUCUAGUGUCGGAGUUGGGUGCAGGCAGGUGCCAUGGGCCCGCUUG… 2169 nt 0.5652
NM_001400545.1 NCBI
AGGUUCUAGUGUCGGAGUUGGGUGCAGGCAGGUGCCAUGGGCCCGCUUG… 1979 nt 0.5548
Showing 21 to 30 of 36 entries
Summary

This gene encodes a myotubularin-related protein. The encoded protein is a phosphoinositide phosphatase that specifically dephosphorylates phosphatidylinositol 3,5-biphosphate and phosphatidylinositol 3-phosphate. Mutations in this gene are correlated with autosomal dominant centronuclear myopathy. Alternate splicing results in multiple transcript variants. A pseudogene of this gene is found on chromosome 18.[provided by RefSeq, Apr 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the MTMR14 within microglial autophagy pathways, as revealed by single-cell RNA sequencing analysis of cortical glial cells [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].