Basic Information

Symbol
MTMR3
RNA class
mRNA
Alias
Myotubularin Related Protein 3 FYVE-DSP1 ZFYVE10 KIAA0371 FYVE Domain-Containing Dual Specificity Protein Phosphatase 1 Phosphatidylinositol-3,5-Bisphosphate 3-Phosphatase MTMR3 Phosphatidylinositol-3,5-Bisphosphate 3-Phosphatase Zinc Finger FYVE Domain-Containing Protein 10 Phosphatidylinositol-3-Phosphate Phosphatase FYVE (Fab1 YGLO23 Vsp27 EEA1 Domain) Dual-Specificity Protein Phosphatase Zinc Finger, FYVE Domain Containing 10 Myotubularin-Related Protein 3 EC 3.1.3.95 EC 3.1.3.48
Location (GRCh38)
22:29883141-30030868
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_021090.4
Sequence length
8987.0 nt
GC content
0.5055

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3236.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3402.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2465.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_021090.4 NCBI
GCUCUGUGUGGCCGCUGCCGCCAUGUUGUUGUGGUUGUGAGAAGGCGGC… 8987 nt 0.5055
NM_153050.3 NCBI
GCUCUGUGUGGCCGCUGCCGCCAUGUUGUUGUGGUUGUGAGAAGGCGGC… 8903 nt 0.5056
NM_153051.3 NCBI
GCUCUGUGUGGCCGCUGCCGCCAUGUUGUUGUGGUUGUGAGAAGGCGGC… 8876 nt 0.5055
Summary

This gene encodes a member of the myotubularin dual specificity protein phosphatase gene family. The encoded protein is structurally similar to myotubularin but in addition contains a FYVE domain and an N-terminal PH-GRAM domain. The protein can self-associate and also form heteromers with another myotubularin related protein. The protein binds to phosphoinositide lipids through the PH-GRAM domain, and can hydrolyze phosphatidylinositol(3)-phosphate and phosphatidylinositol(3,5)-biphosphate in vitro. The encoded protein has been observed to have a perinuclear, possibly membrane-bound, distribution in cells, but it has also been found free in the cytoplasm. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MTMR3 was identified as a high-confidence gene common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159].