Basic Information

Symbol
AREL1
RNA class
mRNA
Alias
Apoptosis Resistant E3 Ubiquitin Protein Ligase 1 KIAA0317 FIEL1 Apoptosis-Resistant HECT-Type E3 Ubiquitin Transferase 1 Apoptosis-Resistant E3 Ubiquitin Protein Ligase 1 Fibrosis-Inducing E3 Ligase 1 EC 2.3.2.26
Location (GRCh38)
14:74653437-74713117
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001039479.2
Sequence length
5417.0 nt
GC content
0.4837

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1780.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1887.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1446.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((.(((........))))))).)))..(((.(((((..((((.....(((((.((.(((..((..((.(((....))).)).))..))))))))))))))..))))).))).((.((((((.((((((((..(((((((.....(((((((((..((.((((((....(((..(.((((..((((((((((((((((((((...))))))))))))...))))))))..(((((.....)))))......((((((((((((((((((((((((((.((((((.((((.......(((((((.....(((((((....(((..(((((....)))))..)))..)))))))))))))).......))))...))))))(((((.((((((((.(((((........((((((((((((((((.....(((.(((((((.......)))))))..))).....))).))).))).)))))))........)))))((((((((...)))))))))))))))).)))))...(((((((......)))))))...)))).))))))))........(((((((((((((((((.(((((((((....................(((((((((((......((...((((.(((((...((.....((.(.((((((((....(((((..(((...)))..))))))))))))).).))......)).))))).))))...)))))))))))))...(((.(((.(((...((((((((.........(((((((..((((((((((...(((((...(((((....))).((((....((((..(((.((((.((((((((((((((((((((((........))).........))))))))))..(((.((((((.(((...))).)))))))))..(((.((((((((.....(((((....)))))......))..)))))).))))))))))))))))..))).)))).))))((((((((.(((((((.........((((.(......).))))..................(((..(((((((((.((.(((((.....................((((.((((((((.......((((((((((((((.((((....)))).)))))))..........((((.((((...((((((....(((.(((((..(((.(((.(((.....(((((((.(((((...........((((..((((........))))..))))((((....))))....))))).))).))))....)))..))).)))..)))....(((((((.(((.(((((((....(((((...(((((((..((((((.....))))))(((.....((((....))))....)))......((((.((.(((((..((....))..)))))..)).))))...)))))))...).))))))))))))))....((((((((((......)))......(((((((......))).)))).......))))))).(((....)))..)))))))..........)))))....))))))...)))).))))(((((.(((............))).)))))..(((.(((...((((((((.(((.((.((((((((....))))).))).)).)))))))..))))....))).))).......(((((((.............(((((((....(((((..((((((((..(((((((((((((...(((((.(((((((((((.((((((((((((((((....((....((((.....................))))..))....)))).))))....((((((..((((((..((((((.((((((((........)))))...))).))))))...))))))..)))))).)))))))).).))))))))))..)))))(((((((((...((((.....(((((((.((.(((((........(((((((((((....((((..((....))))))......((((((((.(((..((((.....(((((...((((((........)))).))....)))))..((((((((((........))))))))))....(((((((((((....((((((((......)))).)))).....)))).))))))).........))))..)).).)))))))).........((((((((((.....(((..........)))...))))))))))((((((.........)))).)))).)))))))))((((.....))))((((((((......((((((((.((((..((((....))))..((((...(((((......)))))))))..(((..(((((........)))))..))).(((((((.......)))))))((((..((((((((((((.(((((.(((((((..(((.(((((((.(((..(((((..((..(((((.(((((.(((((..(((((((((((((.(((.((((.((((((((..(((((...((((.....)))))))))...)))))))).)))).))).).)))))))....)))))..)))))))))).)))))..))..)))))((..(((((((((((((((((((((((((.....((((.....)))).......)))))))))..((((((.(((((.(((...))).)).((((((((((...((((((((..(((.(((((((((...((.....(((..(((((((................((((((..((((.((((.......)))).)).)).))))))..)).)))))..))).....))..)))))).))))))..))).....)))))...((((((((...(((((..(((......)))..))))).(((((((((((((((....(.((((.......(((((................)))))......)))).)....)))....))))))))))))..(((((.....)))))....((..(((((((((((((.....))...(((.(((((...((((...)))).))))).))).((((((.((((((((((......))))((((((((.................)))))))))))))).))))))(((.(((((((..((((((((((((...))))))).((....))((((((((..........)))))))))))))......))))))).)))......((..((((.....))))..)).............((((...))))...((((.....)))).)))))))))))..))(((((......))))).)))))))).)))))))))).))).))))))((.((((.(((((((.(.(((.((.((((........)))))))))).))))))).)))).)).....((((((((...))))))))))).))))).))))))))..))...)))..))))))).)))..)))))))........)))))......(((((..(((((((((.(((((...(((.(((((.(((..(((((((.(((.....((((..(..((((.((((.((.((((.(((((.(((.((.(((((....)))..)).)).)))))))).)))).((((((..(((((.(((((....(((((((((((((.(((((......)))))...)))))..........)))..)))))))))))))))......)))))).(((((.....((((((.......))))))....)))))..........)))))).)))))..))))))).)))))))....))).))))).))).))))).......((((((..((((.((((((((((.((((((..((((((((.((....)).))))))))..........)))))).)...))).)))))).)))).....)))))).((((((((((((((.((.........)).))))...))))).))))))))))))))..)))))(((.((.(((....))).)).)))......((.(((((((....)))).))).))))))))))))))))))(((((((((((....))))))...))))))))).)))))))).......))))))))))))).)))))))))....)))))))))))))((((...(((......)))....))))....((((....((((((((.................((((((((........))))))))))))))))...)))).)))))))))...))))))).)))))))))))))))))(((.((((.......)))).))))))))))......((((..(((....)))....))))............))))))).......))).))))).))))...(((((.(((((..(((((((.......)))))))...))))))))))...(((((...)))))....))))))))))))))))..)))...)))).))).)).)))))).((((((.(((((((((((...(((....))).)))).)))...)))))))))).(((.((((((((((((((......))))..)))...))))))))))))))))))))))))))))))))))..........))))))))....))).))))))...(((((((((...((((((.(((((.((((.((((.....))))..)))).))))).)))))).....((.((.....)).))..((((((.((((.......(((..((((((.......))))))))))))).))))))...)))))))))..........))))))))).))..)))))))))).))))).....((((.....))))...........(((((((((((.(.(((((((.((....((((...(((((((((((..(..(((........)))..)..))))))))))).))))...)).))))))).)(((((......)))))(((.(((......................))).))).....((((((((((((.......(((((....)))))(((((((........)))))))......((((((...))))))..))))))))))))..))))))))))))))))..))))))))).......)))).)..)))...)))))).))...))))...))))).....))))).))..)))))))))))))).))((((((((................)))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((.(((,,...,,.))))))).)))..(({.(((((..{{((,,,..((((((,(.(((..((..{(,{{{....))).)),})}.))))))))))}))),,))))).))).{(.((((((.((((((((.,({((((({{...}}{((((((......((.....((,{((((..(((..((((((((((((((((((((...))))))))))))...))))))))..(((((.....)))))(((((((..((((.({.(((((.,.....((.((((.(((.((((((.{{...}}.))))))))).)))).))|{{{{((((((,...,}}},.,})))))}.((((((((((.((((.........(((((((((((((((.((((((((.(((((({...((((((({((,{(((({{.,,,(({(((((((.......)))))))..,,,}}}.,)))}))).})).)))))))........{(((.((((((((...)))))))).)))}.,(((((((...(((((((......)))))))..(((.((((.(..(((..((((.(((((((((...(.((((({{(((((.((((({{((({{...{((((((,{(((((........{,.}}||}({(((((..,,{.{({{(((({((((((((.,,||{,,..((.((((({.....)))))).)){{||{....,,|||,...}}}..||}...}}||{||||||,,.(((((,((,((((,,...{,,,,,,,|}}}.})}))})),,,.}||},||}},.))))}),.)}}}}},}),}}),))))}.,,......,.}}))))),.}})))).{((((((((({{(,..{{...)})},.,,....)))))))))}.{((((((((((.,.((((((((((((....................{({......))|((((........)))),..)))))))))))).,,{{({((({{{({((({..{((({{...,})),,,,...}},..,,}}}}...,,,,.)))}}.},}})),}}))))}........|,|,((((((.{.(((((.((.........,},.......}}.))))).}.)))))).....||,.,(((((((.((((....)))).)))))))...)),..,,}},...,..))).))).)))))))).))).)))).)))))).))))..))).,,)))).)))...........(({(..((((........))))..})))((((..,{|||,....|||},(((({........))))),.||}}},}))))),.,{(((((.(((.(((((((....(((((...(((((((..((((((.....))))))(((.....((((....))))....)))......,,(({(({({(((.,((,...,,..,)))).,),.),))}}})))))))...)})))))))))))},)}}.)))))}...)))))))))))})}).))).))))).))))...))))))))))).,(({{{{.|||({,..|||..,}},}))...,,,..)))).))))).)))))((((((((.((.((((.((......,{{..(((((,{((((((.(((.(((.,,((((((((.(((.((.((((((((....))))),})).)).)))))))..)))).,,.))).))).....(((((.((((.(({{{,{..((.....)).,,,)}....})}.)))))),})}....)))))))))))))},....{((((((((({.((((((..(((((....({{.........})}....)).))))))))).)}.(((....))),))))))))}..)).})))...))))))))))..,.(((((........))))).}}......}.)))))))))))..)))))))...,(.((((((((((((((((,,.,..{{{,,((((,{..({......}|..}),),}}}}|{{,.,,.,,.,,,,))))))).)))))))))).).,.........)))...)))))))....,)}....))))))}.(((((((.((((((.......(((((((((((.(.((((((((.(((...(((.((((((.......(((((((((((....((((((((......)))).)))).....))))}}))))))......)))))))))))).)))).....(((((((({((((((((((.....(((.,,.....,.)))...))))))))))...{(,{(((.((((((((((((..((((((((({....,(((((((((((((((((...(((((,....((({{{(((({{{{,,||{.,((((((,(((({.....||||||,,|,,,{{{{{......{{(((({.{{{..(((((((((((,,........,)))))).))))).|}|,|||||||({{.|||||||..,,,|{{{{{{,.{,,..|{{{{,,{{{.{{(((.(((((.{((((..{({{{{({((({,.{((.((({,((((((((.{(((((,,,({((.,.,,|}|||}}}|.|||||}}|||.}}}}.|||,|,|||}}}|,,,.|||}}..)))),})))).)))||,{||.{|||||({({(,.{{(((({((({{.{{,||{||||||,.||{,,||.|}}}},,..,}.||||,,}},.}|||,||,|||||,|||,..||}||||{({({{{,{{...|||||.,..,({{{(((({{{{{...{{..{,{({{..{{(((,,....,}}......||,((((((..((((.((((.{....,)))).)).)).)))))),,,),})))),,)))...}}))}}}}}))).)})))),,}}},}.}.))})}},}||{{||||}}.|||||,,{((.,,...}}},.}})))}|{{,||||{||,,{{,.,,|,|{{{.......{||||.....,.,,,.....,}))))}}}}}})|}|.,,,,,)))}},})}}}}),})))|,,.,,||,..}}))}}})}}}}}}}....,,,|||||,....{({{{{(((.(((((...((({...}))).))))).))}.((((((.((((({{(((......)))}((((((((.................)))))))))))))).))))))(((.(((((((.,{(((((((((((...))))))).{(....|,((((((((..........))))))))))}}}}},...))))))).))),.....,({{(((({{{{{{||{{(((..{{(.{{.{{{{(,,,{{{{|||...,{||..{{,||,|{|||,|||||,...))}}),.}}}}}.))))).}}||||,|{||||||,}}|{|||.||||||((.((((.(((((((.(.(((.(,{((((........)))))))))).))))))).)))).)),,{{{.{{{{{{....,||||||||||||{{||,,||((({{..,|.,|,}},.}}}}))).}}},|)),,,}),,......}))))}}}}}}|..((((((..,((((,(((({...(((.(((((.(((..(((((((.{({..,.{((((..{..((((.((((.((.((((.(((({{{((.((.(((((....))}..}).)).)))))))).)))).,{{(((..{{(({,{(({{....{{(({{{{(((({.(((((......)))))...))))).,,......,||..}})))}}}}})))))).....,)))||{{(((((.....,,(((({...,,}))},}}....))))},}}},.,...)))))).))))}..))))))).)))))))....))).))))).))).))))}.}}}),.||||||..,(((.((((((((({.((((((..((((((((.((....)).))))))))..........)))))).}...))).)))))).))))}},.})))))).,||||||||,||||}||}|}}.}}}}),}))))..})))))}))}}|{{{{|,,,.{((((..(((.((.(((....))).)).)))))))}..},|{,(((({((({((((....)))).,|||||{,|,,...,|||,||||},...))))))}}},)},..,|,..,||}||}||,,.....|}}}}}}}}}}.,{((({.,....})))}.(((({...}))))((((((((((((.((((((.,,,.((((.......{(((((((((.(((({,(.,{.({{(((((((.....{{{|||||||,|((({.,{(,..{{{{{{,,||{.||,.,}}||}}|||,{({{,..,|||}}.(((.((((.......)))).)))||}}},},))}})))))}){{,.,}}}}}....((((.(({(.,(((((({....(((({.,{(((({...,...}},}}|{{({{(((((..(((((((.......)))))))...))))))))},......})))}..,((((.(((.......))).)))))))))))))))})))}}}..,,....((((((((((({((((((...(((....))).)))).)))...)))))))))).,,{,((((((((((((((......))))..)))...)))))))})}))}))}}}.}))))).)))))))))).))))...}}}))))))..(((((((((.(({...))).)))...))))))...)))))))))))).{(((((((.((.........)).)))))))|(((((((((((({,,||.,{|,{{(,({{{,|||...,{...{(((((.......))))))}))))})}}}.}}}|,,},|},{((((...})))}...({((((((.{{{{(({{|,{.,..,.....,...))},,....,||{.(({{....)}}},..,}))||{{((((({{{(({{....{,...................{{{........))}))))),))))))))))))))))))))))))),}.}))))))))))))}..,,))))))......)))),})))))))).)))))))))))))))))))))))))).)))))}...})))))))){((((((((........))))))))}..,.(((((((..({...(((((((((..((,{((({{...,}.)))))).)))),.}))))....})..))))))),.)))).).))))))))))))))))))))))))..))))).))..)))))))))))))).)|{{{{{((({{,.,......,....}}})))))}......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001039479.2 NCBI
AAUCCCCCGAGCCGGUUCCCAGGCCGGGUGGAGACCAACUCUGGGGUCU… 5417 nt 0.4837
NM_001411046.1 NCBI
AAUCCCCCGAGCCGGUUCCCAGGCCGGGUGGAGACCAACUCUGGGGUCU… 5480 nt 0.4838
Summary

Enables ubiquitin protein ligase activity. Involved in negative regulation of apoptotic process; protein polyubiquitination; and ubiquitin-dependent protein catabolic process. Located in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human blood samples stored at 4°C identified the AREL1 as one of 13 downregulated transcripts that overlapped with important variables in a random forest model for predicting the time since deposition of bloodstains [Zhang et al. DOI:10.1016/j.forsciint.2024.111930]. This model, based on transcriptomic changes, successfully predicted TSD with high accuracy (AUC=0.995, precision=1, recall=1), and the AREL1 was characterized as a potential time-marker transcript for forensic application.