Basic Information

Symbol
MTO1
RNA class
mRNA
Alias
Mitochondrial TRNA Translation Optimization 1 5-Taurinomethyluridine-[TRNA] Synthase Subunit MTO1, Mitochondrial Protein MTO1 Homolog, Mitochondrial Mitochondrial Translation Optimization 1 Homolog (S. Cerevisiae) Mitochondrial Translation Optimization 1 Homolog Homolog Of Yeast Mto1 Mitochondrial MTO1-3 EC 1.1.1.40 EC 6.3.5 COXPD10 CGI-02
Location (GRCh38)
6:73461578-73509236
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012123.4
Sequence length
10698.0 nt
GC content
0.4245

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4122.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001123226.2 NCBI
GUCCUACCCCGUGAUAUUAAAGCAAGAUGGCCGCGCCCUGCAGAUUGUC… 10818 nt 0.4261
NM_012123.4 NCBI
GUCCUACCCCGUGAUAUUAAAGCAAGAUGGCCGCGCCCUGCAGAUUGUC… 10698 nt 0.4245
NM_133645.3 NCBI
GUCCUACCCCGUGAUAUUAAAGCAAGAUGGCCGCGCCCUGCAGAUUGUC… 10773 nt 0.4256
Summary

This gene encodes a mitochondrial protein thought to be involved in mitochondrial tRNA modification. The encoded protein may also play a role in the expression of the non-syndromic and aminoglycoside-induced deafness phenotypes associated with a specific mutation in the mitochondrial 12S rRNA gene. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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