Basic Information

Symbol
MTPAP
RNA class
mRNA
Alias
Mitochondrial Poly(A) Polymerase SPAX4 TENT6 PAPD1 PAP-Associated Domain-Containing Protein 1 Poly(A) RNA Polymerase, Mitochondrial Polynucleotide Adenylyltransferase Terminal Uridylyltransferase 1 FLJ10486 TUTase 1 PAP Associated Domain Containing 1 EC 2.7.7.19 TUTase1 MtPAP PAP
Location (GRCh38)
10:30309801-30374448
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018109.4
Sequence length
5560.0 nt
GC content
0.4142

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1720.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1822.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1412.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018109.4 NCBI
GCAAUGGCGGUUCCCGGCGUGGGGCUCUUGACCCGUUUGAACCUGUGUG… 5560 nt 0.4142
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the DNA polymerase type-B-like family. This enzyme synthesizes the 3' poly(A) tail of mitochondrial transcripts and plays a role in replication-dependent histone mRNA degradation.[provided by RefSeq, Jan 2011]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that prostatic acid phosphatase, detected via the SM-test reagent, remained a reliable protein marker for semen identification in extremely aged seminal stains stored at room temperature for 33–56 years, with all aged samples testing positive alongside fresh controls [Nakanishi et al. DOI:10.1016/j.legalmed.2014.04.002]. A review of RNA-Seq studies in post-mortem human brains notes that the MTPAP was identified as a shared neuronal function-associated molecular change, being differentially expressed in common hippocampal genes of cocaine-addicted and alcoholic subjects compared to controls [Wu et al. DOI:10.1111/Pcn.12550].