Basic Information

Symbol
MUC15
RNA class
mRNA
Alias
Mucin 15, Cell Surface Associated Mucin-15 MUC-15 PASIII PAS3
Location (GRCh38)
11:26559032-26572263
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001135091.2
Sequence length
3387.0 nt
GC content
0.3614

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-779.57 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -843.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 814.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001135091.2 NCBI
AAUGCUUACAGCUGAGAAGCAGGUCAGUCAGGUUCCUGGGCGCUCUGUU… 3387 nt 0.3614
NM_001135092.2 NCBI
AAUGCUUACAGCUGAGAAGCAGGUCAGUCAGGUUCCUGGGCGCUCUGUU… 3237 nt 0.3590
NM_145650.4 NCBI
AAUGCUUACAGCUGAGAAGCAGGUCAGUCAGGUUCCUGGGCGCUCUGUU… 3299 nt 0.3607
Summary

Predicted to be located in Golgi lumen and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

The literature review notes that the MUC15 is a protein marker showing loss post-mortem in bone, indicating its potential for post-mortem interval estimation in late PMI contexts within forensic proteomics [Alex et al. DOI:10.1016/j.scijus.2025.101320].