Basic Information

Symbol
MUC2
RNA class
mRNA
Alias
Mucin 2, Oligomeric Mucus/Gel-Forming MUC-2 MLP Mucin 2, Intestinal/Tracheal Mucin-2 SMUC Mucin-Like Protein Intestinal Mucin-2
Location (GRCh38)
11:1074875-1110511
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002457.5
Sequence length
15574.0 nt
GC content
0.6183

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4032.27 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002457.5 NCBI
GCAACCCACACCGCCCCUGCCAGCCACCAUGGGGCUGCCACUAGCCCGC… 15574 nt 0.6183
Summary

This gene encodes a member of the mucin protein family. Mucins are high molecular weight glycoproteins produced by many epithelial tissues. The protein encoded by this gene is secreted and forms an insoluble mucous barrier that protects the gut lumen. The protein polymerizes into a gel of which 80% is composed of oligosaccharide side chains by weight. The protein features a central domain containing tandem repeats rich in threonine and proline that varies between 50 and 115 copies in different individuals. Downregulation of this gene has been observed in patients with Crohn disease and ulcerative colitis. [provided by RefSeq, Oct 2016]

Forensic Context

A study in zebrafish demonstrated that the MUC2 transcript, encoding a protective protein, increased in abundance at 12 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].