Basic Information

Symbol
MUC3A
RNA class
mRNA
Alias
Mucin 3A, Cell Surface Associated MUC3 Mucin-3A MUC-3A Mucin 3A, Intestinal Mucin 3, Intestinal Intestinal Mucin-3A Intestinal Mucin
Location (GRCh38)
7:100949422-100968348
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005960.2
Sequence length
11248.0 nt
GC content
0.5203

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2349.78 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2537.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2717.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005960.2 NCBI
ACUUUCAUUACGUGCACGCCCCAGGGCCACGUCCCUGCCGCUGUCUUGG… 11248 nt 0.5203
Summary

The mucin genes encode epithelial glycoproteins, some of which are secreted and some membrane bound. Each of the genes contains at least one large domain of tandemly repeated sequence that encodes the peptide sequence rich in serine and/or threonine residues, which carries most of the O-linked glycosylation (Gendler and Spicer, 1995 [PubMed 7778880]).[supplied by OMIM, Aug 2008]

Forensic Context

A study in human prostate tissue demonstrated that the MUC3A is upregulated in samples with a high postmortem interval (PMI > 3 days) and participates in the protein ubiquitination process [Javan et al. DOI:10.1038/s41598-025-29561-7].