Basic Information

Symbol
MUC6
RNA class
mRNA
Alias
Mucin 6, Oligomeric Mucus/Gel-Forming (Gene/Pseudogene) MUC-6 Gastric Mucin-6 Mucin-6 Mucin 6, Oligomeric Mucus/Gel-Forming Mucin 6, Gastric
Location (GRCh38)
11:1012823-1036718
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005961.3
Sequence length
8016.0 nt
GC content
0.6158

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2751.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2873.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1694.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005961.3 NCBI
AGCCGCAUGGAUGGCAGCAGCAGGCCUGCCGGGCCCAGCGCGAGCUCCU… 8016 nt 0.6158
Summary

This gene encodes a member of the mucin protein family. Mucins are high molecular weight glycoproteins produced by many epithelial tissues. The protein encoded by this gene is secreted and forms an insoluble mucous barrier that protects the gut lumen. [provided by RefSeq, Dec 2016]

Forensic Context

A review of forensic proteomics literature identifies the MUC6 as a protein marker found in seminal fluid for body fluid identification [Alex et al. DOI:10.1016/j.scijus.2025.101320].