Basic Information

Symbol
MUTYH
RNA class
mRNA
Alias
MutY DNA Glycosylase MYH Adenine DNA Glycosylase MutY Homolog A/G-Specific Adenine DNA Glycosylase MutY Homolog (E. Coli) MutY-Like Protein EC 3.2.2.31 EC 3.2.2 HMYH
Location (GRCh38)
1:45329163-45340893
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001048174.2
Sequence length
1708.0 nt
GC content
0.6048

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-711.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -742.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 519.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((..((((....)))).(((((.(.((((((((.((.(((((((((((((.(((..(((((((.((.....((.((......(((((......)))))...((.((..(((..(((((((..((.....((((((((((((((.((.(((...........(((.(((((.(((.((.......)).))).))))).))).((((.......))))...))).)).)))))))))...(((..(((....)))...)))((((......)))))))))..))..)))))))...)))..)).)))).))....)))).)))))..))).)))))).))))))).)))))...((((((.((((.((......)))))).))))))(((((((((((((((((........((((((....((((............((((((.(((......((((.....)))).((((((((((((.((((((((((((.((((((..((((.(((((((((((((((((((.((...((.((((((...))))))))((((((((..((.((((((((....((...(((((((((...((((((.(((.(..(.(((.((((..((((((..(((((((.((((((..((((((.(((((....)))))....(((.((.((((.((.....)).)))).)).)))..(((...)))...))))))..))))))(((.((..(((((((.......)))))))..)).)))(((.((((((((((......))))).))))).))).....(((((((((((.................((((((.((....((((((((((.((.(......).)).)))))))..)))...)).))))))....)))).)))))))))))))).(((.(((((.......)))))....))).)))))))))).))))..).)))))))))....))).))))))....))......))))))))...)).).)))))))))))))).))).)))).)))..))))))))..)))))))))).((((((((((.((((..(((((((....(((((.(........).))))).......)))))))..))))(((((.....(((((....)))))))))).....((((..(((((.(((.((.((((.(((((((((...)))..)))))).)))).))......((((((.((..((((...))))..))...))))))(((((((.....))))))).....)))))))))))).((((((((.......))))))))(((........)))(((((.....)))))))))))))))))))((((.....(((((((.((((.........)))).)))))))(((((((((((((......(((((...(((((((((...((((((.(((....))).)))).))....)))..))))))..(((((((...(((...)))..))))))).)))))..))))).))).))))).....)))).)))).))))))...))))))......))).))))))....((((......))))))))))))))......))))))...))))..)))))))..)))))).))))).)))))..............((.(((........))).)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{((((..((((....)))).(((((.(.((((({({{((.(((((((((((((.(((..(((((((,(({{{,.{{....||.,,(((((......)))))...{({(({.({(..{(({(((.(((.((((((..,{.((((((((((.{(((..{,.{....})}.))}.,.)}})))))))).}..,..))))))..))).,||{((({(((((((((.{.((((....)))),}..))))))))).,||.,.......((((......)))))))))}.},,.))))))}...}||{{,..)))}.,.....}})).)))))..))).))))))}}}))))).))),),.{((((((.((({{((......)))))).))))))|((((((({{((((({,,,{{{{{,{((({(({((({(({,{..,,........||.||}.||||..|||||,..,}.}}}((((((((((((.(((({{{(((((.((((((..(((,,(((((((((((((((((((.(,...{{.((((((...))))))}}((((((({..({.((((((((..{.,{,{.(((((((((.,.((((((.(((.{,.{.(((,((((..(((((({{(((((,,{((((({{.,,,|||.(((((....))))),,.,||}}|,.}}})))),.,,||||||||||{{|||..{{..{{{|{{.,}}}}}}}}))))})|,|}||,,(((((((.......)))))))..}}.,,,(((.((((((((((......))))).))))).))).....(((((((((((....,,,..........({{(((.((,.,,(((((({{((|({.,..,,,,},)).)})))})..})),.,)).)})))),,..)))).)))))))})))),{{(.{{(((((.......)))))..}}))).}))))))))).)))}..),)))))))))....))).))))))....}),,.}..))))))))...)}.),})))))))}))))).))).)))).)))..))))))))..)))))))))).((((((((((,(((({,((((((({.({((,((,({{{{{{{{|.|||,|{{....{|||}|||{{|,,,|||||}....(((((....)))))))))),,}.}||||..{{|||}||{.((.((((.(((((((((...)))..)))))),)))).}),,|,..{(((((.{(..((((...))))..))...)}))}}(((((((.....)))))))..}}.,))))}}},)))})))),)|)}},...,,,,,,,,,,,.......,,|}|{{{{{.....}))))))))))))))}}}}((((.....(((((((.((((.........)))).)))))))(((((((((((((,.....{((((...((((((,{{...(((((({{{,...,}}}}}))).)}....})}..})))))..(((((((...(((...)))..))))))).))))),,)))}}.))).))))).....)))).)))).))))))...)))))){{.....,,..,,}}}}}..,,,{..,,,||})}|,..,,,},},..,,})))))).,,))),.}))))))}..)))))).))))).))))}..,,,.....,,..((.(((........))).)).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001048171.2 NCBI
GUAGUCUCCUCGUGGCUAGUUCAGGCGGAAGGAGCAGUCCUCUGAAGCU… 1858 nt 0.6039
NM_001048172.2 NCBI
AGACGUCCCGGGUCCGGCGCGGGGAAGGCAGCCUGGCGCGCGCUAAUUG… 1784 nt 0.6132
NM_001048173.2 NCBI
AGACGUCCCGGGUCCGGCGCGGGGAAGGCAGCCUGGCGCGCGCUAAUUG… 1781 nt 0.6131
NM_001048174.2 NCBI
CUUUCUCUCCUGCUCUCGCGGCGGGAACGCGGGGCCUCCGUGUUCUGCU… 1708 nt 0.6048
NM_001128425.2 NCBI
GUAGUCUCCUCGUGGCUAGUUCAGGCGGAAGGAGCAGUCCUCUGAAGCU… 1900 nt 0.6047
NM_001293190.2 NCBI
GUAGUCUCCUCGUGGCUAGUUCAGGCGGAAGGAGCAGUCCUCUGAAGCU… 1861 nt 0.6040
NM_001293191.2 NCBI
CUUUCUCUCCUGCUCUCGCGGCGGGAACGCGGGGCCUCCGUGUUCUGCU… 1741 nt 0.6054
NM_001293192.2 NCBI
GUAGUCUCCUCGUGGCUAGUUCAGGCGGAAGGAGCAGUCCUCUGAAGCU… 1794 nt 0.6048
NM_001293195.2 NCBI
CUUUCUCUCCUGCUCUCGCGGCGGGAACGCGGGGCCUCCGUGUUCUGCU… 1858 nt 0.5856
NM_001293196.2 NCBI
AGACGUCCCGGGUCCGGCGCGGGGAAGGCAGCCUGGCGCGCGCUAAUUG… 1717 nt 0.6144
Showing 1 to 10 of 32 entries
Summary

This gene encodes a DNA glycosylase involved in oxidative DNA damage repair. The enzyme excises adenine bases from the DNA backbone at sites where adenine is inappropriately paired with guanine, cytosine, or 8-oxo-7,8-dihydroguanine, a major oxidatively damaged DNA lesion. The protein is localized to the nucleus and mitochondria. This gene product is thought to play a role in signaling apoptosis by the introduction of single-strand breaks following oxidative damage. Mutations in this gene result in heritable predisposition to colorectal cancer, termed MUTYH-associated polyposis (MAP). Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.