Basic Information

Symbol
MUTYH
RNA class
mRNA
Alias
MutY DNA Glycosylase MYH Adenine DNA Glycosylase MutY Homolog A/G-Specific Adenine DNA Glycosylase MutY Homolog (E. Coli) MutY-Like Protein EC 3.2.2.31 EC 3.2.2 HMYH
Location (GRCh38)
1:45329163-45340893
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001048174.2
Sequence length
1708.0 nt
GC content
0.6048

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-711.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -742.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 519.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001350650.2 NCBI
GUAGUCUCCUCGUGGCUAGUUCAGGCGGAAGGAGCAGUCCUCUGAAGCU… 1784 nt 0.6065
NM_001350651.2 NCBI
GUAGUCUCCUCGUGGCUAGUUCAGGCGGAAGGAGCAGUCCUCUGAAGCU… 1720 nt 0.6076
NM_001407069.1 NCBI
GUAGUCUCCUCGUGGCUAGUUCAGGCGGAAGGAGCAGUCCUCUGAAGCU… 1849 nt 0.6041
NM_001407070.1 NCBI
GUAGUCUCCUCGUGGCUAGUUCAGGCGGAAGGAGCAGUCCUCUGAAGCU… 1874 nt 0.6041
NM_001407071.1 NCBI
GUAGUCUCCUCGUGGCUAGUUCAGGCGGAAGGAGCAGUCCUCUGAAGCU… 1877 nt 0.6042
NM_001407072.1 NCBI
GUAGUCUCCUCGUGGCUAGUUCAGGCGGAAGGAGCAGUCCUCUGAAGCU… 1854 nt 0.6036
NM_001407073.1 NCBI
GUAGUCUCCUCGUGGCUAGUUCAGGCGGAAGGAGCAGUCCUCUGAAGCU… 1816 nt 0.6035
NM_001407075.1 NCBI
AGACGUCCCGGGUCCGGCGCGGGGAAGGCAGCCUGGCGCGCGCUAAUUG… 1853 nt 0.6136
NM_001407077.1 NCBI
AGACGUCCCGGGUCCGGCGCGGGGAAGGCAGCCUGGCGCGCGCUAAUUG… 1814 nt 0.6136
NM_001407078.1 NCBI
AGACGUCCCGGGUCCGGCGCGGGGAAGGCAGCCUGGCGCGCGCUAAUUG… 1934 nt 0.5941
Showing 11 to 20 of 32 entries
Summary

This gene encodes a DNA glycosylase involved in oxidative DNA damage repair. The enzyme excises adenine bases from the DNA backbone at sites where adenine is inappropriately paired with guanine, cytosine, or 8-oxo-7,8-dihydroguanine, a major oxidatively damaged DNA lesion. The protein is localized to the nucleus and mitochondria. This gene product is thought to play a role in signaling apoptosis by the introduction of single-strand breaks following oxidative damage. Mutations in this gene result in heritable predisposition to colorectal cancer, termed MUTYH-associated polyposis (MAP). Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.