Basic Information

Symbol
MVP
RNA class
mRNA
Alias
Major Vault Protein LRP Lung Resistance-Related Protein VAULT1 Testicular Secretory Protein Li 30
Location (GRCh38)
16:29820394-29848039
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005115.5
Sequence length
2798.0 nt
GC content
0.6126

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1221.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1264.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 725.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001293204.1 NCBI
UCAUCUUCUUGUGAGCCCUGGGCUUAGGAGUCACCAUGGCAACUGAAGA… 2605 nt 0.6084
NM_001293205.1 NCBI
UCAUCUUCUUGUGAGCCCUGGGCUUAGGAGUCACCAUGGCAACUGAAGA… 2587 nt 0.6057
NM_005115.5 NCBI
GAGAGUUCCCCAUCUGAGGCGUUUGUUGCAGCUACCUGCACUUCUAGAU… 2798 nt 0.6126
NM_017458.3 NCBI
AACUCCCAAGCCCCACCCCUGGGCUUGGCCUGCCUUGCCCUGCCGGGAA… 2943 nt 0.6082
Summary

This gene encodes the major component of the vault complex. Vaults are multi-subunit ribonucleoprotein structures that may be involved in nucleo-cytoplasmic transport. The encoded protein may play a role in multiple cellular processes by regulating the MAP kinase, JAK/STAT and phosphoinositide 3-kinase/Akt signaling pathways. The encoded protein also plays a role in multidrug resistance, and expression of this gene may be a prognostic marker for several types of cancer. Alternatively spliced transcript variants have been observed for this gene. [provided by RefSeq, May 2012]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.