Basic Information

Symbol
MX1
RNA class
mRNA
Alias
MX Dynamin Like GTPase 1 IFI-78K LncMX1-215 MxA Interferon-Regulated Resistance GTP-Binding Protein MxA Interferon-Induced GTP-Binding Protein Mx1 Interferon-Inducible Protein P78 Interferon-Induced Protein P78 Myxoma Resistance Protein 1 Myxovirus (Influenza) Resistance 1, Homolog Of Murine (Interferon-Inducible Protein P78) Myxovirus (Influenza Virus) Resistance 1, Interferon-Inducible Protein P78 (Mouse) Myxovirus (Influenza Virus) Resistance 1, Interferon-Inducible Protein P78 Myxovirus Resistance Protein 1 IFI78 MX
Location (GRCh38)
21:41420020-41470071
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Sudden death from CNS diseases
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002462.5
Sequence length
2776.0 nt
GC content
0.5180

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-908.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -962.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 686.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001144925.2 NCBI
CGAGCAGAAAUGAAACCGAAACUGAAUUGUCCGGGAAAUUCGCGGUGGG… 3444 nt 0.5229
NM_001178046.3 NCBI
GCACUCCAGCACUGCGCAGGGACCGGAAUUCUGUGGCCACACUGCGAGG… 2601 nt 0.5160
NM_001282920.1 NCBI
CUUACUUUGCAAAGAAGGAAGAUGGUUGUUUCCGAAGUGGACAUCGCAA… 1998 nt 0.5205
NM_002462.5 NCBI
GCACUCCAGCACUGCGCAGGGACCGCCUUGGACCGCAGUUGCCGGCCAG… 2776 nt 0.5180
Summary

This gene encodes a guanosine triphosphate (GTP)-metabolizing protein that participates in the cellular antiviral response. The encoded protein is induced by type I and type II interferons and antagonizes the replication process of several different RNA and DNA viruses. There is a related gene located adjacent to this gene on chromosome 21, and there are multiple pseudogenes located in a cluster on chromosome 4. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2013]

Forensic Context

A study in humans identified the MX1 as a high-degree node in a protein-protein interaction network and a potential myocardial infarction biomarker, showing significant upregulation in patient blood samples which was validated in an independent dataset [Zhao et al. DOI:10.3892/etm.2017.5580]. In a mouse model of traumatic brain injury, the MX1 was significantly upregulated in isolated microglia at 14 days post-injury, identified as part of the IFNγ pathway [Izzy et al. DOI:10.3389/fncel.2019.00307]. A separate bioinformatics analysis in humans identified the MX1 as a key hub protein and a cardiac disease predictive biomarker in cardiomyopathy, with receiver operating characteristic curve analysis demonstrating an area under the curve of 0.716 for its diagnostic performance [Rahman et al. DOI:10.1038/s41598-024-78011-3].