Basic Information

Symbol
MXD1
RNA class
mRNA
Alias
MAX Dimerization Protein 1 BHLHc58 MAD1 MAD Max Dimerizer 1 Antagonizer Of Myc Transcriptional Activity Max Dimerization Protein 1 MAX-Binding Protein Protein MAD
Location (GRCh38)
2:69897688-69942945
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002357.4
Sequence length
5549.0 nt
GC content
0.4251

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1580.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1689.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1372.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001202513.2 NCBI
GCUCUGCUCCGGGUUCUGUCACUGUGUCGGCGGUGCCCAGCUCACUGGC… 5546 nt 0.4252
NM_001202514.2 NCBI
GCUCUGCUCCGGGUUCUGUCACUGUGUCGGCGGUGCCCAGCUCACUGGC… 5519 nt 0.4256
NM_002357.4 NCBI
GCUCUGCUCCGGGUUCUGUCACUGUGUCGGCGGUGCCCAGCUCACUGGC… 5549 nt 0.4251
Summary

This gene encodes a member of the MYC/MAX/MAD network of basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors. The MYC/MAX/MAD transcription factors mediate cellular proliferation, differentiation and apoptosis. The encoded protein antagonizes MYC-mediated transcriptional activation of target genes by competing for the binding partner MAX and recruiting repressor complexes containing histone deacetylases. Mutations in this gene may play a role in acute leukemia, and the encoded protein is a potential tumor suppressor. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2011]

Forensic Context

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