Basic Information

Symbol
MXI1
RNA class
mRNA
Alias
MAX Interactor 1, Dimerization Protein BHLHc11 MXD2 MAD2 MXI Class C Basic Helix-Loop-Helix Protein 11 Max-Interacting Protein 1 Max-Related Transcription Factor MAX Dimerization Protein 2 MAX Interacting Protein 1 MAX Interactor 1 Max Interactor 1 BHLHC11
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_130439.3
Sequence length
3470.0 nt
GC content
0.4375

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1014.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1083.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 640.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
CAUCGCCCGAGGCGUCCGCCCUGCAAAUCUGCCAGCCCCCGAGAGGGGU… 3047 nt 0.4033
AAACAAACCACGCGCGGGCUGCCCGCGGCACGGCGGGCGCGGCUGGCGC… 3280 nt 0.4299
AUACACACAGACUCACAGCGAGACCGACACACACUCCCAUACACUCACA… 3470 nt 0.4375
Summary

Expression of the c-myc gene, which produces an oncogenic transcription factor, is tightly regulated in normal cells but is frequently deregulated in human cancers. The protein encoded by this gene is a transcriptional repressor thought to negatively regulate MYC function, and is therefore a potential tumor suppressor. This protein inhibits the transcriptional activity of MYC by competing for MAX, another basic helix-loop-helix protein that binds to MYC and is required for its function. Defects in this gene are frequently found in patients with prostate tumors. Three alternatively spliced transcripts encoding different isoforms have been described. Additional alternatively spliced transcripts may exist but the products of these transcripts have not been verified experimentally. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the MXI1 transcription factor, which is upregulated in astrocytes, microglia, and oligodendrocytes, revealing profound glial cell transcriptomic changes associated with neurotoxicity [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649]. In rats, DNA macroarray analysis identified the MXI1 as upregulated in the frontal cortex of ethanol-naive alcohol-preferring AA rats compared to nonpreferring ANA rats, though this specific finding was not confirmed by subsequent RT-PCR validation [Worst et al. DOI:10.1002/Jnr.20496].