Basic Information

Symbol
MXRA5
RNA class
mRNA
Alias
Matrix Remodeling Associated 5 Adlican Adhesion Protein With Leucine-Rich Repeats And Immunoglobulin Domains Related To Perlecan Matrix-Remodeling-Associated Protein 5 Matrix-Remodelling Associated 5 DKFZp564I1922
Location (GRCh38)
X:3308565-3346652
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015419.4
Sequence length
9804.0 nt
GC content
0.5030

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3114.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3292.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2857.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_015419.4 NCBI
GCUGGGAAGCCGAGCUGCCUCACCCCCGGCCCCGGGAAGGGCAUGGCCC… 9804 nt 0.5030
Summary

This gene encodes one of the matrix-remodelling associated proteins. This protein contains 7 leucine-rich repeats and 12 immunoglobulin-like C2-type domains related to perlecan. This gene has a pseudogene on chromosome Y. [provided by RefSeq, Mar 2010]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MXRA5 is part of a 38-gene transcriptomic signature of obesity, with its expression in subcutaneous adipose tissue showing a positive correlation coefficient of 0.0558 within the signature [Francesc Font-Cloc et al. DOI:10.1088/1361-6579/aab85a].