Basic Information

Symbol
ARF5
RNA class
mRNA
Alias
ARF GTPase 5 ADP Ribosylation Factor 5 ADP-Ribosylation Factor 5
Location (GRCh38)
7:127588370-127591700
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001662.4
Sequence length
1032.0 nt
GC content
0.5940

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-423.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -441.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 293.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001662.4 NCBI
CUGCUGCUGCUGCGCCCCAUCCCCCCGCGGCCGGCCAGUUCCAGCCCGC… 1032 nt 0.5940
Summary

This gene is a member of the human ADP-ribosylation factor (ARF) gene family. These genes encode small guanine nucleotide-binding proteins that stimulate the ADP-ribosyltransferase activity of cholera toxin and play a role in vesicular trafficking and as activators of phospholipase D. The gene products include 6 ARF proteins and 11 ARF-like proteins and constitute 1 family of the RAS superfamily. The ARF proteins are categorized as class I (ARF1, ARF2,and ARF3), class II (ARF4 and ARF5) and class III (ARF6). The members of each class share a common gene organization. [provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

A study in rats and mice demonstrated that the ARF5 was identified as a downregulated same-trend differentially expressed gene in the corpus cavernosum of animals with age-related erectile dysfunction, where multi-omics analyses revealed conserved molecular mechanisms involving downregulation of mitochondrial activity and disruption of protein homeostasis [Long et al. DOI:10.1093/sexmed/qfaf078].