Basic Information

Symbol
MXRA8
RNA class
mRNA
Alias
Matrix Remodeling Associated 8 Limitrin Matrix Remodeling-Associated Protein 8 Matrix-Remodelling Associated 8 DKFZp586E2023 Matrix-Remodeling-Associated Protein 8 ASP3
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Chronological age estimation

MANE select

Transcript ID
NM_032348.4
Sequence length
2293.0 nt
GC content
0.6607

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1088.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1123.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 474.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((..........(((((((((..((((....((((((.(((((..(((((...)))))....((((..(((..(((..(((..(((((((.(((((....(((.((((((((.....(((((....).))))(((((((((((((.((((..(.(((((.(((..((((((.(((((((((((((((.((((((((.((((((((.(((((((.(((((.(((((.(....(((......))).....))))))))))).))))...))).)...))))))).))(((((((((..(((((((.(((((((((........)))))))))((((((((.(.((.((((((.(((((..((..((....)).)))))))))))))(((.((...)).))).))..).))))))))..)))))))((((.((.(..((..(((((........)))))..))..).)).))))....)))))))))......)))))).)))))))))...((((......)))).))))))))))...))..))).))))).).....)))).)))))))))))))((((((.....))))))...((.((((((.....)))))))).((((((..((((((.((.((((((((.((......(((((((((.(((((((..((((.((..((((((((((......))).))))).))((((.(((........))).)))).(((((((((((((((.((.........((((....)))))))))))))))))).)))..(((((((((((((....))))))))).)))))).))))..)))).)))..(..((((........))))..))))))))))........(((.(......).))))).)))))))).)).)))))).......))))))(((((((....((((((....))))))...)))))))((((((((((((((.((((..............)))).))))....((..(((((.......((((.(((((((((((................((((((..(((((.....)))))..))))))))))))..(((((((.((((((...(.(((((((((.(((....))))))).))))))..(((....))))))))).)).)))))........)))))..))))......)))))..)).)))))))))))))))))).)))..))))).))))))).)))...))))))..))))................((((((((((((((.(((((((((..(((....(((((((...........((((.....((..((((....))))..)).....))))..)))...))))....))))))))))))..)))).)))))))).)).(((..((((((((((((....))))))))))))..)))))))).)))))))))).)))))))))...((((...((((((..((....))..))))))..)))).....))))))).((((((((((((((((((((...(((((((.((.(.((((((((.((((((((((..((((((((((((...............((((((....(((.((((((((.......(((((...))))))))))))).)))..........((((....)))))))))).....(((.((((((....))))))..)))...((((((.(((((..........))))))))))))))))))).))))....((((((((.((((((((...(((........)))..((((.((((.(((((..((((((((((((((...((((((....)))))))).))))))...))).))).))))).))((.((((...)))).)))).))))......))))))))))))))))..((((.(......).))))....((..(.....)..))...))))))))))((((..........))))..........((.(((((..(((((((.(((....(((((....((.((((((.((....)).))))))))...........((((..(((((((((((((....)).)))))))))))..)))).......)))))...)))..)))).)))..))))).)))))))))).).))..))))))).)))))))))))))....(((.........)))...((.((((((.....)))))).)).....))))))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({(((.(,,,,.,{{,.(((((((((..((((....((((((.(((((..(((((...)))))...,((((..((,.,(((..(((.,(((((((.((((({{{{,,(,((((((((.....(((((....).))))(((((((((((((.((((.,(.(((((.(((..((((((.(((((((((((((((.((((((((.(((((((,.(((((((.(((((.(((((((.,.{(,,....}},),}}}.,})))))))))).)))}..,))).,...))))))),)}(((((((((.{(((((((.(((((((((........)))))))))((((((((.(,({.((((((.(((({{{(,{{((....}}.}}}))))))))))|||,{|,.,}},))).,,..}.))))))))..)))))))|(((.((.(..((..(((((........)))))..))..).)).))}}....)))))))))......)))))).))))))))).,.((((......)))),))))))))}}.,}))..))).))))).),....)))).)))))))))))))((((((.....))))))...{(.((((((.....)))))))}.((((((..((((((.((.((((((((.((......(((((((((.,(((,((((((({,(({{({((((((((......))).))))).}}|||{|(,{,.,,,.}|||}|}}}|.((((((((((((((({((.........((((....)))))))))))))))))).))).,(((((((((((((....))))))))).)))))},}}}}}||||}|||,..,..||||,.......))))..,)))))))))......|{({{.,......,.))))).)))))))).)).)))))).......))))))(((((((....((((({....})))))...))))))){(((((((((((((,((((,....,........)))).)))},,,.{(..(((((.....,.((((.(((((((((({.{{{.....,,....,((((((.,(((((.....)))))..))))))))))}}..(((((((.((((((...(.(((((((({{(((....))))))).))))),..(({....})))))))).)).)))))........)))))..))))......)))))..)}.)))))))))))))))))),)))}.))))).)))))))}))}...))))))..))))................{,((((((((((((.(((((((({,(((((...((((.((........,..(((......||},{(((....))))..}}.....,,)).))))...)))),...})})))))))))..)))).)))))))).,,.(((..((((((((((((....))))))))))))..)))))))).)))))))))).))))))))}..,|(({...{(((((..((....))..)))))|..}}},.....}}}}}},,(((({{{(((((({(({{{{...{{{{{{{,|{|||{{||||,..{(((((({{{.,{{{||||{{(({...............{{((((..,.(((.((((((((.......(((((...))))))))))))).))).|......,,((((....)))))})))).....(((.((((((....))))))..)))...||{{{{{{(|{{..,}},,,,.))))))))}}}}))))))),|||},,..((((((((.((((((((...{{{...,....|||..((((.({((.(((((..(((((((((((({(...((((((....))))))}}.))))))...))).))).))))).}}{,.((((...)))).}))).)))).,,,..))))))))))))))))..((((.(......).))))....((..{...,.}..)}...))))))))))||||,}||,,,,..{{{,,,,{.,,,{(((.(((((..(((((((.(((....(((((....({.((((((.((....)).))))))}}.......,...((((..(((((((((((((....)).)))))))))))..)))).......)))))...)))..))))}}))..))))).)))})}))))..)))..))))))).))))))))))))),.,}||,}}},.....,}}...{{.((((((.....)))))).},.....}))}),}.............

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AAUAGCUUGAAACUGGAAGGCAGAGACUUAGAGCCGAGUGGGACAAAGC… 2310 nt 0.6584
AGAAUCCAAAGGCCGUAGGAGAAAGAAGGCUGGCGGUGUUUCCUCUUAG… 2751 nt 0.6572
GGAGAGAGACUUAGAGCCGAGUGGGACAAAGCCUGGGGCUGGGCGGGGG… 1990 nt 0.6457
ACUUAGAGCCGAGUGGGACAAAGCCUGGGGCUGGGCGGGGGCCAUGGCG… 2008 nt 0.6614
GGAGAGAGACUUAGAGCCGAGUGGGACAAAGCCUGGGGCUGGGCGGGGG… 2293 nt 0.6607
Summary

Predicted to be involved in establishment of glial blood-brain barrier. Located in extracellular exosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A review of human multi-omics studies for biological age estimation identified the MXRA8 as an aging-associated transcriptome feature, where its expression was negatively correlated with aging in whole blood samples from a cohort of healthy people [Ilya Solovev et al. DOI:10.1016/j.mad.2019.111192].