Basic Information

Symbol
MYBPC1
RNA class
mRNA
Alias
Myosin Binding Protein C1 Myosin-Binding Protein C, Slow-Type SsMyBP-C Slow Skeletal-Type Muscle Myosin-Binding-Protein C Slow MyBP-C MYBPCS C-Protein, Skeletal Muscle Slow Isoform Myosin Binding Protein C, Slow Type Skeletal Muscle C-Protein MYOTREM CMYO16 CMYP16 MYBPCC LCCS4
Location (GRCh38)
12:101568353-101686181
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002465.4
Sequence length
4082.0 nt
GC content
0.4505

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1170.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1251.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1043.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001254718.3 NCBI
GUCACACCGACCUGCACCAUCUCUCGCCUGCCUGUGGGGUUUCUGUCAA… 3860 nt 0.4570
NM_001254719.3 NCBI
GUCACACCGACCUGCACCAUCUCUCGCCUGCCUGUGGGGUUUCUGUCAA… 3849 nt 0.4544
NM_001254720.3 NCBI
GUCACACCGACCUGCACCAUCUCUCGCCUGCCUGUGGGGUUUCUGUCAA… 3813 nt 0.4527
NM_001254721.3 NCBI
GUCACACCGACCUGCACCAUCUCUCGCCUGCCUGUGGGGUUUCUGUCAA… 3792 nt 0.4541
NM_001254722.3 NCBI
GUCACACCGACCUGCACCAUCUCUCGCCUGCCUGUGGGGUUUCUGUCAA… 3771 nt 0.4524
NM_001254723.3 NCBI
GUCACACCGACCUGCACCAUCUCUCGCCUGCCUGUGGGGUUUCUGUCAA… 3708 nt 0.4558
NM_001404675.1 NCBI
GUCACACCGACCUGCACCAUCUCUCGCCUGCCUGUGGGGUUUCUGUCAA… 3822 nt 0.4584
NM_001404676.1 NCBI
GUCACACCGACCUGCACCAUCUCUCGCCUGCCUGUGGGGUUUCUGUCAA… 3690 nt 0.4558
NM_001404677.1 NCBI
GUCACACCGACCUGCACCAUCUCUCGCCUGCCUGUGGGGUUUCUGUCAA… 3612 nt 0.4538
NM_001404678.1 NCBI
GUCACACCGACCUGCACCAUCUCUCGCCUGCCUGUGGGGUUUCUGUCAA… 3733 nt 0.4535
Showing 1 to 10 of 17 entries
Summary

This gene encodes a member of the myosin-binding protein C family. Myosin-binding protein C family members are myosin-associated proteins found in the cross-bridge-bearing zone (C region) of A bands in striated muscle. The encoded protein is the slow skeletal muscle isoform of myosin-binding protein C and plays an important role in muscle contraction by recruiting muscle-type creatine kinase to myosin filaments. Mutations in this gene are associated with distal arthrogryposis type I. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

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