Basic Information

Symbol
MYCBP2
RNA class
mRNA
Alias
MYC Binding Protein 2 PAM KIAA0916 PHR1 MYC Binding Protein 2, E3 Ubiquitin Protein Ligase E3 Ubiquitin-Protein Ligase MYCBP2 PAM/Highwire/RPM-1 Protein 1 Protein Associated With Myc Myc-Binding Protein 2 FLJ10106 RING-Type E3 Ubiquitin Transferase MYCBP2 EC 2.3.2.33 Highwire Myc-Bp2 Phr
Location (GRCh38)
13:77042474-77327094
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015057.5
Sequence length
15077.0 nt
GC content
0.4424

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4515.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4798.09 kcal/mol
Frequency: 1.03595e-199
Diversity: 3483.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_015057.5 NCBI
AGCUUCCCAUUGCGGGUAGCCCCGGCGGUGGUGGCGGUGGUAGCGGUGG… 15077 nt 0.4424
Summary

This gene encodes an E3 ubiquitin-protein ligase and member of the PHR (Phr1/MYCBP2, highwire and RPM-1) family of proteins. The encoded protein plays a role in axon guidance and synapse formation in the developing nervous system. In mammalian cells, this protein regulates the cAMP and mTOR signaling pathways, and may additionally regulate autophagy. Reduced expression of this gene has been observed in acute lymphoblastic leukemia patients and a mutation in this gene has been identified in patients with a rare inherited vision defect. [provided by RefSeq, Mar 2017]

Forensic Context

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