Forensic RNA Knowledge Base

Basic Information

Symbol

MYL12B

RNA class

mRNA

Alias

Myosin Light Chain 12B MRLC2 Myosin Regulatory Light Chain 20 KDa Myosin, Light Chain 12B, Regulatory Myosin Regulatory Light Chain MRLC2 Myosin Regulatory Light Chain 12B Myosin Regulatory Light Chain 2 SHUJUN-1 MLC-2A MLC-2 MLC20 Myosin Regulatory Light Chain 2-B, Smooth Muscle Isoform MYLC2B MLC-B

Location (GRCh38)

18:3261479-3278461

UCSC Genome Browser Search in Marker Scope

Forensic tag(s)

Drug abuse diagnoses

External database

HGNC

NCBI

Ensembl

OMIM

UniProt

GTEx

MANE select

Transcript ID

NM_033546.4

Sequence length

1163.0 nt

GC content

0.4162

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.

Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.

Minimum free energy

-304.40 kcal/mol

Thermodynamic ensemble

Free energy: -331.91 kcal/mol

Frequency: 0.0000

Diversity: 285.53

MFE Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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Transcripts

ID	Sequence	Length	GC content
NM_001144944.1 NCBI	CUGCCCUCCCGGCGCCGCGGCGGGUCCUGGCGGUGGAUUGGGGCCGACC…	1041 nt	0.4361
NM_001144945.1 NCBI	AGGGUGGAGGAGCCUCCUGUUGCACGGUCUUGCCUAAGGUGAAGCCUCC…	963 nt	0.4091
NM_033546.4 NCBI	AGGCAGGAAGUGUCGGCGCCGCCACUGUCCGGCCACAGCCUAACGCUCU…	1163 nt	0.4162

Summary

The activity of nonmuscle myosin II (see MYH9; MIM 160775) is regulated by phosphorylation of a regulatory light chain, such as MRLC2. This phosphorylation results in higher MgATPase activity and the assembly of myosin II filaments (Iwasaki et al., 2001 [PubMed 11942626]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly upregulated the MYL12B in oligodendrocytes, specifically within the regulation of actin cytoskeleton pathway, as part of profound transcriptomic changes across cortical glial cells [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].