Basic Information

Symbol
MYL9
RNA class
mRNA
Alias
Myosin Light Chain 9 MYRL2 MRLC1 MLC2 LC20 Myosin Regulatory Light Chain 2, Smooth Muscle Isoform Myosin, Light Polypeptide 9, Regulatory Myosin Regulatory Light Polypeptide 9 Myosin Regulatory Light Chain MRLC1 Myosin, Light Chain 9, Regulatory Myosin Regulatory Light Chain 1 Myosin Regulatory Light Chain 9 20 KDa Myosin Light Chain Myosin RLC MLC-2C Epididymis Secretory Sperm Binding Protein MMIHS4
Location (GRCh38)
20:36541490-36551447
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006097.5
Sequence length
2786.0 nt
GC content
0.6023

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1101.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1148.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 700.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006097.5 NCBI
AGUUCCACGCACCCAGCGAGCCCAAGCGCCUUCUCCGCACCAGGGAAGC… 2786 nt 0.6023
NM_181526.3 NCBI
AGUUCCACGCACCCAGCGAGCCCAAGCGCCUUCUCCGCACCAGGGAAGC… 2624 nt 0.6029
Summary

Myosin, a structural component of muscle, consists of two heavy chains and four light chains. The protein encoded by this gene is a myosin light chain that may regulate muscle contraction by modulating the ATPase activity of myosin heads. The encoded protein binds calcium and is activated by myosin light chain kinase. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human and rat corpus cavernosum tissues identified MYL9 as a myofibril component widely expressed in smooth muscle cells (SMCs) in both species [Yin et al. DOI:10.1016/j.celrep.2024.114760]. In human skin wound healing research, the MYL9 was identified as a myosin light chain marker expressed in a smooth muscle cell cluster via spatial transcriptomics [Liu et al. DOI:10.1016/j.stem.2024.11.013]. A study in mice demonstrated that the MYL9 gene (MYL9) was differentially expressed in blood leukocytes 2 hours after injury, showing downregulation in a burn model but upregulation in models of lipopolysaccharide infusion and trauma/hemorrhage compared to sham controls [Brownstein et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00213.2005].