Basic Information

Symbol
MYLK2
RNA class
mRNA
Alias
Myosin Light Chain Kinase 2 MLCK2 SkMLCK KMLC Myosin Light Chain Kinase 2, Skeletal/Cardiac Muscle Myosin Light Chain Kinase 2, Skeletal Muscle EC 2.7.11.18 Skeletal Muscle Myosin Light Chain Kinase EC 2.7.11 MLCK
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification Mixture deconvolution

MANE select

Transcript ID
NM_033118.4
Sequence length
2799.0 nt
GC content
0.5970

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1156.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1200.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 766.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((.(((((....))))).))))..((((((((.(((((((.....(((((((((((((..((((.((((....)).)).)))).)))....(((((((...((((............)))).(((((..((((((((...(((((((.((.(((((...............((.(((....))).)).(((((((....(((((((((((((((.....))))(((((.(..............(((((.......(((((((((........(((((...(((((..((...))..))))).)))))(((((.....((((((..((....((....)).....))..))))))..)))))((.(((((((((((........))).)))))))).)).((.((((....))))...))(((..(((....))).))).....(((..(((((........)))))..)))..((((....))))......)))))))))......)).))).).))))).....))))))))).))...)))))))...))))).))...)))))))...)))).......)))).)))))....)))))))((((((((((((.((.(((((((.((((((.....))))))((((((..((((.........((((..(.(((((.((((((((..(((...................(((((.....))))).......((((.(......))))).))).)))))))).))....))).)..))))....(((..((((((...((((...))))..)))))).)))........((((((((((.((((((((...))))..)))).((((..(((.(((..((((((((....(((((.((((((((((((((((((.........((((.((((((((..(((.......)))..))))...)))).))))......)))).)).)).)))))))))).((((((((((...((((..((..........))..))))))))))))))))))))))))))).....))).))).))))(((((((.((((..(((((((..((((((((..((((((((..(((((....(((((((((((..((.((((.(.....(((.(((((((((((((.((.....)).)))....))))).).)))).)))..).))))....))..))))))))).)).((....((((((.....))))))...)).(((((((.(.((.((((....(((.((((((((((.((........)).)))))))))))))((((........))))........)))).)).))))))))((((((....(((.((.....)).)))...))))))...((.(((...))))).......)))))..((.(((((((((....))))))))))).(((((......))))).)))))))).))))))))....)))).......(.((((((.((((....)))).)))))).).(((((((.((((((.......)))))).((((.....(((((.((...((.(((((.(((((((..(((((.(((((((((.(((........((((...........))))..((((...)))).....))).))))))))))))))...).))))))))))).))...)).)))))...))))...((((((.((...(((.(((...(((....(((((((...((.(((.....((((((.(((.((..........((((.....)))).....((((.....))))...((((((((.(((.((....(((((.....))..))).....)).))).))))))))((((((((((((.((.((((((...(((..(((((.(.....(((((...)))))).)))))..)))......))))))...(((......))).))))))))))))))(((((((.((....)).))))))))).))))))))))))))(((((.......)))))..)))))))...))))))))).))))))))((((.(((((((((((.(((....)))................((((((.......)))))))))))).......)))))))))..........)))))))..((......)))))..)))).)))))))..))))).)))))))))..))))))(((((.(((....))))))))((((((((..(((((((........)))).)))..)))))))).))))).)).))..)))))))).))))((((((.((((((....((((((((((.((((.((((....(((.(((((..(((......))).)))))..))).)))).)))).)).(((.....))).....))))))))))))))...)))).)).....((((...((.....(.(((((.((..(((((((((...((.((((((((.(.((((((..(((((((.....))))))).......((((.....)))).))..)))).).)))))))))).((.((((.(((.....((...))..(((((((.(((.....(((((.....)))))....)))...)))))))((((((...))))))...))).)))).)).......))))))))).)).))))).).....))..))))..)))))))))))).)))))))))))))....((((.(((........)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((.(((((....))))).))))..((((((((.(((((((.....(((((((((({((..((((.((((....}).)).)))).))}...((....))....((((.((((.(((..((((.(((.....(((..{(..((((((((......(({{(..,{.........((.(((....))).)}.{{((|{.....{{||||(((((((((.....))))((((((((.,,.{{..,{....}}..||.,,...,,...{{......}}.(((((...(((((..{{...})..))))).)))))(((((.....((((((..((.,..((....))..,..))..))))))..)))))..)))))))).((((..((((((((((({{...,{(({,..{|||,.,{||||.||(|({,..{((.(,,.,(((((.....(((..(((((........)))))..))).((((((....((...(({{{(((((((((....,((((((.(.((((...{{{(,{{..(((,(({.....))).))),,))))...))))).)))),)}},.((((((((((,,((((((,.,((,((((({......|(({{{..,|{{|||.|(((((.....}))))}.{((((.......}}}}...{(({{..(.{{{{{.((((((((..(((.......,.......,.||(((((.....)))))..,,,.,{(((.{......}))),.))).)))))))).)),...}}}.)..)))).,.}|}}|.}||||..,....,}},|||{||,.,|||,||,...,}.|}}|{((((((({...|)))))))))||}|((({{((.((((((({{(((({{{{.((..,,,,,{||((((((((((((((((((...{((((....))))}.(((({.(,,......,,))},)}|}{{.{{||...)))}.}}.}))).)).)).)))))))))),}}}}}}))))))))|.,.||||..|||,,....||}}|||({|,..{{(({(((({{(((({(,{.........,{{{({.....,..}}...{(((.,,({((({{{{(,.,{{||{,,.}||||,..,}||(((((((((..((.{(((.{...|.(((.(((((((((({,{{(({....,,.,,}}}}}))))).}.)))).))),.}.))))....))..))))))))),||{,,..{{(((,,({.{{{,|||||{{{{|{.(((((((,,(,{((((.(({(((.((((((((((.((........)).))))))))))))),,||}.,}...))),)}}}}}}}},)),}))}),,)))).,|||,|}..}|||},,..}}}))})))}}})))))},..({.(({...}))))..,....}}}|}.,{{,(((((((((....)))))))))||.{||||,.,|,||||||.|}}},))),,}))))|}.,,,,}}}..,.}}})}|||,||,,||)))},)))}..,,}))}}.,})))))))})))}}))))))})))))))))).,...(((((.((...((.(((((.(((((((..(((((.(((((((((.(((.,,,.,,,({,{.....,,{{{{||}}..,|,|,}})))).....))).))))))))))))))...)}))))))))))).))...)).)))))))))).)))))))),..}}.))))))((....(((.....)))....)))))))|}|,.))).))).}|}})),.,,,.....((((.....)))).||,,((((.....))))...)),.}))))))))))..)))).............))))).|||||||.||{,|{((({((((((({{((({,((((((...,((..(((((((.(((((((......(((((.((((((........))))))....)))))....((((.(((.{.....,..))).))))..,........)))))))))))))){|{.{||}}|||||,,.....)))))}}.,},}}}...}}}|},|,|,,{||,||}},,|,((.((((((((.(((....})).,....,.........((((((.,....,))))))))))))))})))).}}.))))))))))..},|}|||.,..,))))}....))))))))))..))).,...))).))))((({(({((((((({,,...{{((.,,,|}((((.(((((((((..(((((((........)))).)))..))))))))).)))).,}|.|,.||||{((.(((((((.((.((((.((((((((((((((({.((((.((((....(((.(((((..(((......))).)))))..))).)))).)))),{(.(((.....))))}))))))|,||.(((((((.(((((.(({....(((,..|||....,,....||{{..||||||||{{,......,,,,,,,,.,........(((((((,...,))))))).,.,.,.})),},},})))..))}))).)))))))))))))).,...||...}},}.)))))).))..,,(((.(((((((....))||))))))))))).)))))))))..))|||||{||...,)))))))}})}))))),,|,......}|||||,.,.)))))..)))...)))).))))...)))))))))))).))))))))))))).,,,(({{(({{.......,))))))}.,..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACAACUGCCCAGGACUGCUCCUGAGCAGCCGCUGGGAGACAGACGGCAA… 2799 nt 0.5970
Summary

This gene encodes a myosin light chain kinase, a calcium/calmodulin dependent enzyme, that is exclusively expressed in adult skeletal muscle. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MYLK2 is an mRNA marker used in a targeted massively parallel sequencing assay for the specific identification of skeletal muscle tissue [Hanson & Ballantyne DOI:10.3390/genes8110319]. Targeted MPS assays for tissue identification, including those utilizing the MYLK2, have been successfully applied in forensic contexts, demonstrating high specificity, sensitivity, and the capability to detect mixtures and degraded samples [Haas et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2021.102486].