Basic Information

Symbol
MYO1B
RNA class
mRNA
Alias
Myosin IB Myr1 Unconventional Myosin-Ib MMI-Alpha MYH-1c MMIa MYO1B Variant Protein Myosin-I Alpha Myosin I Alpha
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_001130158.3
Sequence length
5069.0 nt
GC content
0.4178

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1410.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1507.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1526.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.(((((((..((......))....))).))))..))))))....((((((((.((((((.((.((((...((((..((.(((((...(((.((((......)))).)))......))))).)).)))))))).))))))))..(((((.((.((((((((((((((((.(((((((((((......)))).(((.((((....((((.....))))..))).).))).....((((((((.....)))))))).........((((((.((((((.....((((((...))))))(((...(((((................)))))))).((.((((..((((((....(((..(((((.........)))))..))).((((((........((.((.(((..((((((.(((....))).))))))..))).)).))))))))...........((((.((((((.((.((((.(((.....(((((.(.(((((..(((.(((........).)).)))....))))).))))))...))).))))))))).............))))))).((((.(((((((...)))))))))))..))))))..)))).))(((((((..((........))..)))))))....)))))))))))).((((.(((((((((..(((((((.(((..((((........)))).))).)))))))(((((....))))).........)))))))))..))))(((((((((((........))).))))))))....(((((.((((((...))))))..)))))..........))))))))))))......))))))))))))))))))..(((...)))...(((((...((.((((((((((((...((((((....))))))..(((((..(((((((.(((((((((.(((((((((((((....((((((.(((((((((...((((.(((((((...(((((((((...))))))))).)))))))..))))((((((((((.((((......))))..((((.....))))...(((((((((((((((((((.(((((((((........)))..(((((...((((((........(((..(((((((..((......))..)))))))..)))...(((((((((........(((((((((.............)))))))))..)))))))))))))))...)))))(((((((((((..(((..((...(((((.......)))))((((((((((((.(.....).)))).)))))))).......(((........)))))..)))..))))))))))))))))))))))))....)))))))..))).))....(((((((..(((((((.((((........)))).))...))))).....((((((.(((....(((((((.............)))))))....)))))))))..((((.((.((((((.(((((.((((...........((((((((................))))))))..((((.(((...))))))))))).(((((........)))))))))).)).)))).))))))....)))))))...........))))).)))))..(((((((....)))))))..(((((.((((.(((((((((..((((.(((((.((((.(((((..(((.....(((((((...))))))))))..)))))...))))((((((..((((((.......)))))))))))).....))))).))))....(((((((.((((((.((((.(((((((...........((((((....))))))...((((.(((...((((((..(((((........))))).....))).))).)))..))))(((((.((((....(((((.......................))))).(((((.......)))))...............((((((..((((((((((.(((((.........))))))))))))))))))))).)))).)))))..)))))))))))..))))))(((((((........)).))))).......((((((....)))))).....))))))).((((((((.((((((..(((.(.....).))).)))))).))))))))..............((((.(((((...(((((......))))).))))).))))................(((......)))....))))))......))).)))).))))).((((((((................)))))))).....))))))....(((((((((((((((.(((((((((((((.(((((.((((((..(((..(((((((((((.......(((.((.(((((....((((((((((((.(..((........))..).)))).))))..)))).......))))).)).)))...((.......))(((((......)))))........)))).)))))))..).))....))))))...((((((((.(((.(.(.(((((((((((((........(((.(((....))))))(((((((((....))))))))).....(((..((((((........((((.(((((((.((..((((((((((...((.......((.(((.(((....(((((....(((((((..((((.....))).).....))))))))))))..))).))).)).......)).))))))))))..((((.((((((.......((((((((((.((...........((((((.((.(((...........(((((((((((.....((((.....((((((((......)).))))))......))))...(((((....)))))((((.....)))))))).))))))).......................(((((((..(((.......)))...))))))).))).))))))))......((((........))))....))))))))))))..(((.(((...((.....))...))).)))................((((((...((..((...(((((((((((((................((((....))))...(((.....)))(((...)))................(((((((((.((((........((((.((.......))))))(((.((.(((((.......))))))).)))..(((((.........((((((......))))))..((((...)))))))))....)))).))..)))))))......)))))))))))))...))..))..))))))..............)))))).)))).(((((((((....((((((((....)))).))))...)).)))..))))....((((.(((..........))).))))((((((...((((..(((......))).....)))).....))))))..........)).))))))).)))).....))))))....)))))))))))).....))))).).))))))))))))))))...))))))))))))).)))))))..((((....(((..(((((((.....((((((((((...))).)))))))((((((((((((...(((....)))))))))))).)))...(((((((...........((((.(((((((......))))))))))))))))))((((..((((.....(((.((((.(........).)))).))).....)))).))))....)))))))..)))....))))....................)))..)))))..))).))))))....))))).)))))))).............((((((...((((.(((((...))).)))))).))))))........((((((((......))))))))..))))).)))).))))))).((((..((((((.((.(..((((((....))))))..).)).))))))..))))......(((((((((.....)))))))))(((.((((((................)))))).)))........(((.((((....)))).)))..........)))))..)))))))))).)).)))))))(((((((((....((....))....)))))))))...((((((.....))))))))))))))..((((......))))(((((((.((((((((((......))))..((.(((((((((((((......)))....)))))))))).))(((....)))..................((.((.((((((((((...((((((((.....((((((((...((((((...........))))))...((((...))))))))))))....(((((((.(((((...(((((((((((((((...(((((....)))))...))))))).......((((((....(((((((((.(((....(((((((((.((((.....((((((((((....)))))))..)))....)))).))))............(((..((((.(((((((....(((((.((((((.....((((.((((.((........)))))).))))...)))))).......((((((((.((((((((((...)))))).)))).))))))))))))))))))).)...))))..))))))))....))).)))))))))...))))))...)))).))))...)))))..))))))).........((((.(((((.(((((((((..((..........))..)))))...)))))))))))))))))))))..)))))))))).)).)).)))))).)))))))......)))))....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((({{.(((((((((,(,{....||{{{.,||{||||,,||||||,...{,|||,,||||||{|{{({{,{({{{{{{{{.(({{((((.{.{{{.{(((......)))}|}||{{|..,))))).))})))))))),)))|||}|{{(((.{|{{{,||||.|,|||.,|||..}}}}}}|}),,.)))))))))}}||.||,.,}|||{||||,,|||{.{{||{|{|{{{....,(((((,,..}}})),}}}|}||.|......,{(({,(((((((({,.((((((...)))))),,,,.,{((((....}}}}}}.....{(((.....((((((((((((,(((((...,.....,,,.}}}}}...{{(|(((({.......)))}}})},}.))))(((((((((((((((((((((((.(((,({((((((((((({,,,...,,,,.....((((.((((((.((.((((.(((.....(((({,(.(((((..(((.({(........).}}.)))....))))).))))))...))).))))))))).............))))))).{(({{(((((({...})))))))))|{{{{.{,,...},}}))|{{{{{{..{{...,,...}}..|||||||.,,{,||.....)),,,||||}|||{||{{,..(((((((.(((..((((........)))).))).))))))).,,,,.,{{||,||{..{{{{..,,)))),,),,))))(((((((((((........))).))))))))....(((((.((((((...))))))..)))))...,....,)))).)))))))).)).}))..)))))))))(((((.,.(((((..............))))).)))))((.(((((((((((....))))))...))))).))......})))))))).))))}(((.(((((...........((....}}..{((((.((((((,.,.(((((((((...))))))))).)))))))..))))}((((.(((((..(((((,....((((((((..(((((((({.{{{(((((((((((((((,{(((((({({........}}}..(((({...((((((........{((..(((((((..({......})..)))))))..))}...(((((((((........(((((((((.............)))))))))..)))))))))})))))...))))){((((((((((..(((..((...{((((,....,.))))|((((((((((((.(.....).)))),,))))))),......(((........)))))..)))..))))))))))})))))))))))}}.,},))))))),}}}|,||.,..{(({(((,.(((((({.,({,.....,.})))),,,}}})))),......,,,,,.})))))))}(((((....}}}}|,.((.{{.((((((((,(|,{|....((((.((.((((((.(((((.((((,.........,((((((((................)))))))),.{(((.(((...))))))))))}.(((((........)))))))))).)).)))).)))))).,......))...))..)))))))),..)).}}.,,....{(((((((.......,...)))))))})))))))).,)))))....))))))))).))))).))}...(((((({...})))))))))))))).....)))){(((((..((((((.......)))))}||{((((((.((..(((({({((((((((.((,..{({((((((..{(((((.((((((.((,(((((((((.(((...)))(((.(((((..(((....)))((((((.((((.,.{((.{(((((..{{(....,,,|||..(((({{(....,{{{,,,,........,,,.........,,|||,((((,....,,,|||},.........,,,,,.{(((({..|{||{{{{{|,|||||,,,,,,...}}}}||||||||}}|||||}}.{.||||,,.})}||{|{..(((((.(((((((((({((((.(((...,{({..{{.{{{{.{,,,,....}))),))..},,.)))))))|(((((((.((((((..(((.,.....).))).)))))).)))))))}........,,,,..{(((.(((((...(((((,....,))))).))))).)))}........,.......|||...,{,|,....}))}})},.....))))))))).).))))).}}}))}}}}.,..}}}}}}}}{{|{(((|....,}},}...,,,||||((((((((......(((.,,.((((((((((..(((..(((((,....((((...........(((.((.(((((....((((((((((((.(..,,........,}..}.))))}})))..)))).......))))).)).)))...))}}......}.))))))))..))))))))))...,,)))...)))))))),))),,)}}))}}},..,,))))))}),,.)))).)))))){(((({{(((({({(.(((....)))))))))),||||..}}))))}.)))))..))))))..))))))..}},.))))))..)))}.})),.)))(..((((......))))..}...}}),)))))))))))))}}...)))).)))))))),...,||,..{(((({.,(((....})).}.,}}}}.,|||.,,,||{{.,||(({.{((({.{((,.....}}},|||||,||,.|}.....,,||}..}}}))),))}))))}}}......(((((((((((...,,((((.....((((((({......}}.))))))......}))).,|{{{({,,,.})}))|{({.....,}}})))).))))))).,{((((((({.{{,{{..........,,,...((((((,.(((((...(({{((((((((((((((.((((((((((((((((..(((....))){((({{((......))))))}....((((((((((((((((..,{((((.((((..{(({(((,..,,.,{{.,,{{{{{{{{{{(((,,{,{{,.........{{((,...}}||,,,(((.....)}}{{{...})),.,,..........,,(((({{,((,({((.{{,....,,|}|,|,...}}}),,,))|||}{{.,,(((((((((((..{((.(((({.({.,....,,...})))).))}..)))}}))))))}....,||||||}},..,{||||,,}..|||||||{.....||||||||}}}},..{||{.||{{|.||||{{...{((((.((((...{{.({{{{{............,,,|{{,,....))))},)),)))))))))..)))).,}.|||},.}})),,...,,.}}},}}}}|{,{,{{{.(({{..||,,.....|||{,...)))),...,},,.||,.....,|,...}}}}}}}}||||}}}}}||}}},,..,}))})),,,,........})))}))))))}}},,)))}}..,,})))).))))))))).,,.)))))))))))).)))).,|,{{{{,.....((((((((({...)))}})))))){,{(((((((({..,(((....}))))))))))).}}}{,,{{{{|,,....,}}},,,||{,.{((((((,,,|..})))))},}}}}}}}},.{((((((((|...,.(((.,((((((({,.....,,{{{....{|||,|||{.,,||}...,}}}},..}))))}}}}..}}}.,................,(((((({..,,(({...,|.{(((((((.{{......))))).))))).,,...,}}}...}))))))))))))))))))))))))))))))}..{{....}}...))))))))))))))))).))))),.))))))}})))))|)},||||||.{{.,..(((({{....})))))..|,||.,})))}.,{{{.....}}|{{{{{{{(,.,.,|}}}}}}},(((.((((((...,,...........)))))).)))..,,,||}}}}}))},.{((((((...{,..((......))..}}...)))))))..,{|||||{{({|{{{|,.....||,,,,}}.,,,|{{{{{{{|{...,,,,.}}})}))))}.,}))))},..((({......))))(((((((.((((({{(((......)))}..{(.((((((((((({{......}})....)))))))))).)}(((....))),....,.,,,........{{.{{.((((((((((.,.((((((((.....((((((({.|.,,{{{{,....{{{......,,..,,{(({...))))}})}}}}}....(((({((.{((((...(((((({((((((((.,.(((((....))))).,.)))))))}.....{(((((,...|(((((({{(,(((,...((((({{{||||||.....,{||{||{{|,,..}}}}}||,,,}},,,|})}}.,}}}..,.,.,,,,,||||,.|{{{,|||{{{,.,,{((({,.,,,,||}||,,,,{||||||,..,||}|,,,,.}}|}|}))}},,|||||,...}}}}{(((((((.((((((((({...)))))).)))).)))))))),}))))))}}}.,....)))},}}))))))....))).)})))))))},})))))),,.}))).))))...))))}..))))))).........{{{{.(((((.(((({(({{.,((,.........}}.,)))},.,,)))))))))}}}})))))))),.)))))))))).,}.}}.)))))).)))))))......)))))....................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GAGCACUCCGCAGCUGGGUGCGCACGGGAGCCUCAACCGCGGCGCGUGG… 5069 nt 0.4178
GAGCACUCCGCAGCUGGGUGCGCACGGGAGCCUCAACCGCGGCGCGUGG… 5054 nt 0.4169
GAGCACUCCGCAGCUGGGUGCGCACGGGAGCCUCAACCGCGGCGCGUGG… 4982 nt 0.4167
GAGCACUCCGCAGCUGGGUGCGCACGGGAGCCUCAACCGCGGCGCGUGG… 4982 nt 0.4161
GAGCACUCCGCAGCUGGGUGCGCACGGGAGCCUCAACCGCGGCGCGUGG… 4895 nt 0.4149
Summary

Enables ATP binding activity; actin filament binding activity; and microfilament motor activity. Involved in actin filament organization and post-Golgi vesicle-mediated transport. Located in several cellular components, including actin filament; endosome; and trans-Golgi network membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human lung cancer patients demonstrated that the C allele of the MIAT rs1061541 polymorphism was a protective factor against non-small-cell lung cancer (NSCLC) [Zheng et al. DOI:10.2147/CMAR.S163395]. In human ischemic cardiomyopathy, single-nucleus RNA sequencing identified the MYO1B as a marker for angiogenic endothelial cells, with its presence in capillaries validated by in situ hybridization [Simonson et al. DOI:10.1016/j.celrep.2023.112086].