Basic Information

Symbol
MYO5A
RNA class
mRNA
Alias
Myosin VA Unconventional Myosin-Va Myoxin MYR12 MYH12 MYO5 GS1 Dilute Myosin Heavy Chain, Non-Muscle Myosin VA (Heavy Chain 12, Myoxin) Myosin, Heavy Polypeptide Kinase Myosin Heavy Chain 12 Myosin-12 Myosin V Myosin VA (Heavy Polypeptide 12, Myoxin) Myosin-Va
Location (GRCh38)
15:52307281-52529132
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001382347.1
Sequence length
12130.0 nt
GC content
0.4271

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3490.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3730.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3041.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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NM_001142495.2 NCBI
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NM_001382347.1 NCBI
AGUCCGCUCGGGCGGCCGCCCAGGCGAGGUGCGGCCUCCGCACAGGCGG… 12130 nt 0.4271
NM_001382348.1 NCBI
AGUCCGCUCGGGCGGCCGCCCAGGCGAGGUGCGGCCUCCGCACAGGCGG… 12250 nt 0.4268
NM_001382349.1 NCBI
AGUCCGCUCGGGCGGCCGCCCAGGCGAGGUGCGGCCUCCGCACAGGCGG… 12175 nt 0.4274
NM_001411135.1 NCBI
AGUCCGCUCGGGCGGCCGCCCAGGCGAGGUGCGGCCUCCGCACAGGCGG… 12046 nt 0.4277
Summary

This gene is one of three myosin V heavy-chain genes, belonging to the myosin gene superfamily. Myosin V is a class of actin-based motor proteins involved in cytoplasmic vesicle transport and anchorage, spindle-pole alignment and mRNA translocation. The protein encoded by this gene is abundant in melanocytes and nerve cells. Mutations in this gene cause Griscelli syndrome type-1 (GS1) and neuroectodermal melanolysosomal disease, or Elejalde disease. [provided by RefSeq, Sep 2023]

Forensic Context

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