Basic Information

Symbol
ABLIM1
RNA class
mRNA
Alias
Actin Binding LIM Protein 1 Limatin LIMAB1 AbLIM Actin-Binding LIM Protein Family Member 1 Actin-Binding LIM Protein 1 AbLIM-1 Actin-Binding Double-Zinc-Finger Protein Actin-Binding Double Zinc Finger Protein KIAA0059 ABLIM
Location (GRCh38)
10:114431110-114768061
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002313.7
Sequence length
7560.0 nt
GC content
0.4598

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2330.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2468.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2169.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001352440.1 NCBI
GACUAGUUUUACUUAUUGGAACCGUCUCUAGCUGGUGCUCGGUCCUCCU… 7598 nt 0.4658
NM_001352441.1 NCBI
GACUAGUUUUACUUAUUGGAACCGUCUCUAGCUGGUGCUCGGUCCUCCU… 7493 nt 0.4639
NM_001352442.2 NCBI
GACAUUGCAAGUUGGAUGCUGUGAACACAGGUCUCAUGCUUUCAUCUCC… 7216 nt 0.4555
NM_001352443.2 NCBI
GUGAGAGAGCGUGCCUGCCCGCCGCACACGGGGCUGGUUUCCGGAGUGC… 6851 nt 0.4526
NM_002313.7 NCBI
AGAGAGAAUUGUGGGGCAGCACCGCUCCUUGGGUCCCCACUCCCCAUUU… 7560 nt 0.4598
NM_006720.4 NCBI
GUGAGAGAGCGUGCCUGCCCGCCGCACACGGGGCUGGUUUCCGGAGUGC… 6824 nt 0.4508
Showing 21 to 26 of 26 entries
Summary

This gene encodes a LIM zinc-binding domain-containing protein that binds to actin filaments and mediates interactions between actin and cytoplasmic targets. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jun 2017]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the ABLIM1 is an mRNA marker down-regulated with increasing age in blood, identified via microarray and validated by TaqMan qPCR for age estimation [Zubakov et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2016.05.014]. Subsequent research in a Chinese human population confirmed the ABLIM1 as a differentially expressed gene overlapping with previously reported age-related mRNA markers, contributing to a robust age prediction model constructed using machine learning algorithms [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373].