Basic Information

Symbol
MYO6
RNA class
mRNA
Alias
Myosin VI KIAA0389 Unconventional Myosin-VI Unconventional Myosin-6 DFNA22 DFNB37 Deafness, Autosomal Recessive 37
Location (GRCh38)
6:75749175-75919537
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004999.4
Sequence length
8615.0 nt
GC content
0.3896

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2277.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2438.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2272.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001300899.2 NCBI
GGAGACCGACUCGGGAUCUGUCCGAGCAGGAAGCCAGCCUCAGCCCGGC… 8546 nt 0.3897
NM_001368136.1 NCBI
GGAGACCGACUCGGGAUCUGUCCGAGCAGGAAGCCAGCCUCAGCCCGGC… 8519 nt 0.3900
NM_001368137.1 NCBI
GGAGACCGACUCGGGAUCUGUCCGAGCAGGAAGCCAGCCUCAGCCCGGC… 8576 nt 0.3900
NM_001368138.1 NCBI
GGAGACCGACUCGGGAUCUGUCCGAGCAGGAAGCCAGCCUCAGCCCGGC… 8531 nt 0.3894
NM_001368865.1 NCBI
GGAGACCGACUCGGGAUCUGUCCGAGCAGGAAGCCAGCCUCAGCCCGGC… 8642 nt 0.3896
NM_001368866.1 NCBI
GGAGACCGACUCGGGAUCUGUCCGAGCAGGAAGCCAGCCUCAGCCCGGC… 8615 nt 0.3899
NM_004999.4 NCBI
GGAGACCGACUCGGGAUCUGUCCGAGCAGGAAGCCAGCCUCAGCCCGGC… 8615 nt 0.3896
Summary

This gene encodes a reverse-direction motor protein that moves toward the minus end of actin filaments and plays a role in intracellular vesicle and organelle transport. The protein consists of a motor domain containing an ATP- and an actin-binding site and a globular tail which interacts with other proteins. This protein maintains the structural integrity of inner ear hair cells and mutations in this gene cause non-syndromic autosomal dominant and recessive hearing loss. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2014]

Forensic Context

A study in human keratinocytes and mouse skin demonstrated that X-ray irradiation downregulated the MYO6 (0.66-fold) alongside numerous other genes, identifying it as part of the transcriptional response to ionizing radiation-induced skin injury [Koike et al. DOI:10.1269/jrr.46.173]. In porcine skin, exposure to bromine vapor also resulted in the downregulation of the MYO6 (approximately 2.4-fold) at 48 hours post-exposure, as part of a broader molecular network altered by chemical insult [Rogers et al. DOI:10.1002/jbt.20383].