Basic Information

Symbol
MYO9B
RNA class
mRNA
Alias
Myosin IXB Unconventional Myosin-IXb Unconventional Myosin-9b CELIAC4 MYR5 Myosin-IXb
Location (GRCh38)
19:17075728-17214537
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004145.4
Sequence length
7606.0 nt
GC content
0.6045

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3119.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3242.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2069.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130065.2 NCBI
GCGGCGGGGCGGAGCGGCUCGAGCAGCGGCGGGCUGGCAGGCGGUCGUC… 7618 nt 0.6041
NM_004145.4 NCBI
GCGGCGGGGCGGAGCGGCUCGAGCAGCGGCGGGCUGGCAGGCGGUCGUC… 7606 nt 0.6045
Summary

This gene encodes a member of the myosin family of actin-based molecular motor heavy chain proteins. The protein represents an unconventional myosin; it should not be confused with the conventional non-muscle myosin-9 (MYH9). The protein has four IQ motifs located in the neck domain that bind calmodulin, which serves as a light chain. The protein complex has a single-headed structure and exhibits processive movement on actin filaments toward the minus-end. The protein also has rho-GTPase activity. Polymorphisms in this gene are associated with celiac disease and ulcerative colitis susceptibility. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MYO9B mRNA exhibits temporal degradation in semen over 0–1.5 years, identifying it as a biomarker for time since deposition estimation [Lei et al. DOI:10.1093/gpbjnl/qzag007].