Basic Information

Symbol
MYOCD
RNA class
mRNA
Alias
Myocardin MYCD MGBL
Location (GRCh38)
17:12665890-12768949
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001146312.3
Sequence length
8565.0 nt
GC content
0.4497

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2521.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2685.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2399.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001146312.3 NCBI
AAUCGCCGGCAGCCUAUGACAUCAGACAGGAACGCCUGGGAUGCCGCGC… 8565 nt 0.4497
NM_001378306.1 NCBI
AAUCGCCGGCAGCCUAUGACAUCAGACAGGAACGCCUGGGAUGCCGCGC… 8609 nt 0.4496
NM_153604.4 NCBI
AAUCGCCGGCAGCCUAUGACAUCAGACAGGAACGCCUGGGAUGCCGCGC… 8421 nt 0.4476
Summary

This gene encodes a nuclear protein, which is expressed in heart, aorta, and in smooth muscle cell-containing tissues. It functions as a transcriptional co-activator of serum response factor (SRF) and modulates expression of cardiac and smooth muscle-specific SRF-target genes, and thus may play a crucial role in cardiogenesis and differentiation of the smooth muscle cell lineage. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Sep 2009]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MYOCD shows low expression in pericytes, distinguishing them from other cell types within the corpus cavernosum [Zhao et al. DOI:10.1038/s41467-022-31950-9].