Basic Information
Symbol
MYOD1
RNA class
mRNA
Alias
Myogenic Differentiation 1
BHLHc1
MYOD
Myoblast Determination Protein 1
Myogenic Factor 3
MYF3
PUM
Class C Basic Helix-Loop-Helix Protein 1
Myf-3
MYODRIF
CMYO17
CMYP17
BHLHC1
Location (GRCh38)
11:17719571-17722136
Forensic tag(s)
Wound age identification
MANE select
Transcript ID
NM_002478.5
Sequence length
1803.0 nt
GC content
0.6556
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-795.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-822.04 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
313.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGGGGUGAGGAAGCCCUGGGGCGCUGCCGCCGCUUUCCUUAACCACAAA… | 1803 nt | 0.6556 |
Summary
This gene encodes a nuclear protein that belongs to the basic helix-loop-helix family of transcription factors and the myogenic factors subfamily. It regulates muscle cell differentiation by inducing cell cycle arrest, a prerequisite for myogenic initiation. The protein is also involved in muscle regeneration. It activates its own transcription which may stabilize commitment to myogenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for MYOD1 Gene
Forensic Context
A study in rats demonstrated that the MYOD1 is upregulated in a time-dependent manner during skeletal muscle wound healing, with its relative mRNA expression peaking at 3 days post-injury (>2.59). Specific expression thresholds were correlated with wound age, where a relative MYOD1 protein quantity >1.33 suggests a wound age of 3 to 7 days, and a relative mRNA expression >2.02 suggests a wound age of 1 to 7 days post-injury [Tian et al. DOI:10.1007/s00414-015-1251-x].