Basic Information

Symbol
MYT1L
RNA class
mRNA
Alias
Myelin Transcription Factor 1 Like KIAA1106 ZC2HC4B ZC2H2C2 NZF1 Myelin Transcription Factor 1-Like Protein Neural Zinc Finger Transcription Factor 1 MyT1-L MRD39 MyT1L
Location (GRCh38)
2:1789113-2331664
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001303052.2
Sequence length
7144.0 nt
GC content
0.4677

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2149.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2290.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1818.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001303052.2 NCBI
CCUAAGCUACUGCACACUAAACAGUGAGAGAGCUUUUCCCUGCAGUCUU… 7144 nt 0.4677
NM_001329844.2 NCBI
CCUAAGCUACUGCACACUAAACAGUGAGAGAGCUUUUCCCUGCAGUCUU… 7220 nt 0.4686
NM_001329845.1 NCBI
GGAGAAUUUUCUGGGUGAGUCCCUAAGAUGGAAGGCAGGGGUGGCUGCC… 7026 nt 0.4693
NM_001329846.3 NCBI
AGUCUCCCCACGGAAACCACAGUCAGAGCUGUGCUCUGUGGAAAGCCUG… 6337 nt 0.4890
NM_001329847.2 NCBI
AGUCUCCCCACGGAAACCACAGUCAGAGCUGUGCUCUGUGGAAAGCCUG… 7105 nt 0.4733
NM_001329848.1 NCBI
CACAGGCGGGACUCGCAGCCCGGCGCUGUCUGUCUGCUGCCUUUUGAUG… 7203 nt 0.4694
NM_001329849.3 NCBI
CCUAAGCUACUGCACACUAAACAGUGAGAGAGCUUUUCCCUGCAGUCUU… 6376 nt 0.4826
NM_001329851.3 NCBI
CCUAAGCUACUGCACACUAAACAGUGAGAGAGCUUUUCCCUGCAGUCUU… 7434 nt 0.4654
NM_001329852.3 NCBI
AGUCUCCCCACGGAAACCACAGUCAGAGCUGUGCUCUGUGGAAAGCCUG… 7401 nt 0.4707
NM_015025.4 NCBI
CCUAAGCUACUGCACACUAAACAGUGAGAGAGCUUUUCCCUGCAGUCUU… 7138 nt 0.4678
Summary

This gene encodes a member of the zinc finger superfamily of transcription factors whose expression, thus far, has been found only in neuronal tissues. The encoded protein belongs to a novel class of cystein-cystein-histidine-cystein zinc finger proteins that function in the developing mammalian central nervous system. Forced expression of this gene in combination with the basic helix-loop-helix transcription factor NeuroD1 and the transcription factors POU class 3 homeobox 2 and achaete-scute family basic helix-loop-helix transcription factor 1 can convert fetal and postnatal human fibroblasts into induced neuronal cells, which are able to generate action potentials. Mutations in this gene have been associated with an autosomal dominant form of cognitive disability and with autism spectrum disorder. Alternative splicing results in multiple variants. [provided by RefSeq, Jul 2017]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MYT1L was identified as a high-confidence gene in common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159].