Basic Information

Symbol
NAA40
RNA class
mRNA
Alias
N-Alpha-Acetyltransferase 40, NatD Catalytic Subunit NAT11 N-Acetyltransferase 11 (GCN5-Related, Putative) N-Alpha-Acetyltransferase 40 N-Alpha-Acetyltransferase D Protein Acetyltransferase 1 N-Acetyltransferase 11 FLJ13848 PATT1 HNatD NatD N(Alpha)-Acetyltransferase 40, NatD Catalytic Subunit, Homolog (S. Cerevisiae) N(Alpha)-Acetyltransferase 40, NatD Catalytic Subunit, Homolog N(Alpha)-Acetyltransferase 40, NatD Catalytic Subunit N-Alpha Acetyl Transferase 40 NatD Catalytic Subunit EC 2.3.1.257
Location (GRCh38)
11:63938669-63957319
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024771.4
Sequence length
3649.0 nt
GC content
0.5163

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1314.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1379.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1025.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001300800.1 NCBI
AGCGUCACGCCCGCCCCUUCCUGCUUCGCGGACCCGUUACUGGCCUCCC… 3752 nt 0.5189
NM_024771.4 NCBI
GUCCGCUCUGCUGCCGCCGCUGUUGCAGCCACCGCCGUUGCCGCCUCCC… 3649 nt 0.5163
Summary

Enables histone H2A acetyltransferase activity; histone H4 acetyltransferase activity; and protein N-terminal-serine acetyltransferase activity. Predicted to be involved in chromatin remodeling. Predicted to act upstream of or within lipid metabolic process. Located in centriolar satellite; cytosol; and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic alcohol exposure significantly downregulated the NAA40 mRNA in hippocampal tissue, as identified through high-throughput sequencing and bioinformatic network analysis [Du et al. DOI:10.3389/Fphar.2024.1377501].