Basic Information

Symbol
NANOS1
RNA class
mRNA
Alias
Nanos C2HC-Type Zinc Finger 1 NOS1 ZC2HC12A Nanos Homolog 1 EC_Rep1a NOS-1 Nanos Homolog 1 (Drosophila) SPGF12
Location (GRCh38)
10:119029714-119033730
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_199461.4
Sequence length
4017.0 nt
GC content
0.5091

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1424.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1498.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1061.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_199461.4 NCBI
GCGGCAGGCCGGCGGGCAGGCUCGGCGUGUCCCUUCCGUCCGGCCCGCG… 4017 nt 0.5091
Summary

This gene encodes a CCHC-type zinc finger protein that is a member of the nanos family. This protein co-localizes with the RNA-binding protein pumilio RNA-binding family member 2 and may be involved in regulating translation as a post-transcriptional repressor. Mutations in this gene are associated with spermatogenic impairment. [provided by RefSeq, Sep 2015]

Forensic Context

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