Basic Information

Symbol
NAP1L1
RNA class
mRNA
Alias
Nucleosome Assembly Protein 1 Like 1 NRP Nucleosome Assembly Protein 1-Like 1 NAP1L NAP1 NAP-1-Related Protein MGC23410 MGC8688 HSP22-Like Protein Interacting Protein HNRP
Location (GRCh38)
12:76032987-76085261
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004537.7
Sequence length
13159.0 nt
GC content
0.3734

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3662.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3920.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3060.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001307924.3 NCBI
CUUUUUUAGCGCCAUCUGCUCGCGGCGCCGCCUCCUGCUCCUCCCGCUG… 2165 nt 0.3783
NM_001330231.2 NCBI
CUUUUUUAGCGCCAUCUGCUCGCGGCGCCGCCUCCUGCUCCUCCCGCUG… 4297 nt 0.3440
NM_001330232.2 NCBI
CUUUUUUAGCGCCAUCUGCUCGCGGCGCCGCCUCCUGCUCCUCCCGCUG… 4136 nt 0.3426
NM_004537.7 NCBI
CUUUUUUAGCGCCAUCUGCUCGCGGCGCCGCCUCCUGCUCCUCCCGCUG… 13159 nt 0.3734
NM_139207.5 NCBI
CUUUUUUAGCGCCAUCUGCUCGCGGCGCCGCCUCCUGCUCCUCCCGCUG… 4325 nt 0.3450
Summary

This gene encodes a member of the nucleosome assembly protein (NAP) family. This protein participates in DNA replication and may play a role in modulating chromatin formation and contribute to the regulation of cell proliferation. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms; however, not all have been fully described. [provided by RefSeq, Apr 2015]

Forensic Context

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