Basic Information

Symbol
NAPEPLD
RNA class
mRNA
Alias
N-Acyl Phosphatidylethanolamine Phospholipase D NAPE-PLD C7orf18 FMP30 N-Acyl-Phosphatidylethanolamine-Hydrolyzing Phospholipase D NAPE-Hydrolyzing Phospholipase D Chromosome 7 Open Reading Frame 18, N-Acyl-Phosphatidylethanolamine-Hydrolyzing Phospholipase D EC 3.1.4.54 EC 3.1.4
Location (GRCh38)
7:103099776-103151172
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001122838.3
Sequence length
5140.0 nt
GC content
0.3768

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1364.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1464.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1417.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001122838.3 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 5140 nt 0.3768
NM_001386176.1 NCBI
GACAUCAUUUUAAAAGUAAACGAUCACACAGUGAACAAUGCCGUGCUCC… 4981 nt 0.3684
NM_001386177.1 NCBI
GCGGAACUGAGGCGGCGCGCGCUCCCGGCCACCCCAAGCGCGAGUUCUU… 4895 nt 0.3718
NM_001386179.1 NCBI
GCGGAACUGAGGCGGCGCGCGCUCCCGGCCACCCCAAGCGCGAGUUCUU… 4594 nt 0.3764
NM_001386182.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 4727 nt 0.3808
NM_001386185.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 5284 nt 0.3753
NM_001386190.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 5238 nt 0.3830
NM_001386191.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 4780 nt 0.3824
NM_001386193.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 4983 nt 0.3797
NM_001386194.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 5028 nt 0.3761
Showing 1 to 10 of 20 entries
Summary

NAPEPLD is a phospholipase D type enzyme that catalyzes the release of N-acylethanolamine (NAE) from N-acyl-phosphatidylethanolamine (NAPE) in the second step of the biosynthesis of N-acylethanolamine (Okamoto et al., 2004 [PubMed 14634025]).[supplied by OMIM, Oct 2008]

Forensic Context

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