Basic Information

Symbol
NAPEPLD
RNA class
mRNA
Alias
N-Acyl Phosphatidylethanolamine Phospholipase D NAPE-PLD C7orf18 FMP30 N-Acyl-Phosphatidylethanolamine-Hydrolyzing Phospholipase D NAPE-Hydrolyzing Phospholipase D Chromosome 7 Open Reading Frame 18, N-Acyl-Phosphatidylethanolamine-Hydrolyzing Phospholipase D EC 3.1.4.54 EC 3.1.4
Location (GRCh38)
7:103099776-103151172
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001122838.3
Sequence length
5140.0 nt
GC content
0.3768

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1364.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1464.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1417.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001386204.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 4897 nt 0.3806
NM_001386205.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 4903 nt 0.3722
NM_001386207.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 4687 nt 0.3759
NM_001386208.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 5252 nt 0.3759
NM_001386209.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 5352 nt 0.3817
NM_001386210.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 5025 nt 0.3761
NM_001386211.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 4791 nt 0.3713
NM_001386212.1 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 5113 nt 0.3769
NM_001386213.1 NCBI
GCGGAACUGAGGCGGCGCGCGCUCCCGGCCACCCCAAGCGCGAGGUGAG… 5130 nt 0.3862
NM_198990.6 NCBI
ACACUGCUGAGCCUGGGGUGGUUUGGAAUUCUUCGGCGAAGUGGAGCGG… 4839 nt 0.3815
Showing 11 to 20 of 20 entries
Summary

NAPEPLD is a phospholipase D type enzyme that catalyzes the release of N-acylethanolamine (NAE) from N-acyl-phosphatidylethanolamine (NAPE) in the second step of the biosynthesis of N-acylethanolamine (Okamoto et al., 2004 [PubMed 14634025]).[supplied by OMIM, Oct 2008]

Forensic Context

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