Basic Information

Symbol
NBEA
RNA class
mRNA
Alias
Neurobeachin BCL8B LYST2 KIAA1544 Lysosomal-Trafficking Regulator 2 FLJ10197 Protein BCL8B EC 1.14.14.5 EC 6.1.1.11 NEDEGE
Location (GRCh38)
13:34942270-35673022
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001385012.1
Sequence length
11200.0 nt
GC content
0.4321

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3294.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3510.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2668.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001204197.3 NCBI
ACUCAUGGAUAUAGGCACACAAACUAAAGGUUCUUGCAUACACUGAGGG… 4030 nt 0.4072
NM_001379245.1 NCBI
GCAGUGGCUGCUACCGCAGGCAGGGGGCGGCAACAUGGCGGAGUGAGCG… 11191 nt 0.4321
NM_001385012.1 NCBI
GCAGUGGCUGCUACCGCAGGCAGGGGGCGGCAACAUGGCGGAGUGAGCG… 11200 nt 0.4321
NM_015678.5 NCBI
GCAGUGGCUGCUACCGCAGGCAGGGGGCGGCAACAUGGCGGAGUGAGCG… 11137 nt 0.4325
Summary

This gene encodes a member of a large, diverse group of A-kinase anchor proteins that target the activity of protein kinase A to specific subcellular sites by binding to its type II regulatory subunits. Brain-specific expression and coat protein-like membrane recruitment of a highly similar protein in mouse suggest an involvement in neuronal post-Golgi membrane traffic. Mutations in this gene may be associated with a form of autism. This gene and its expression are frequently disrupted in patients with multiple myeloma. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. Additional transcript variants may exist, but their full-length nature has not been determined.[provided by RefSeq, Feb 2011]

Forensic Context

A study in humans delineated age-associated mRNA expression patterns in peripheral blood and established a robust age prediction model using 34 mRNA markers, including the NBEA which overlapped with genes previously reported in other studies [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373].