Basic Information

Symbol
ARHGAP26
RNA class
mRNA
Alias
Rho GTPase Activating Protein 26 OPHN1L GRAF KIAA0621 OPHN1L1 Rho GTPase-Activating Protein 26 Oligophrenin-1-Like Protein GRAF1 GTPase Regulator Associated With Focal Adhesion Kinase Pp125(FAK) GTPase Regulator Associated With The Focal Adhesion Kinase Pp125 GTPase Regulator Associated With Focal Adhesion Kinase Rho-Type GTPase-Activating Protein 26
Location (GRCh38)
5:142770377-143229011
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification Individual identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001135608.3
Sequence length
9226.0 nt
GC content
0.4704

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3098.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3266.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2223.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001135608.3 NCBI
AGACACCGGCGGGGCGGCCGAGGCUGCUGUGAGAGGGCGCUCGAGGCUG… 9226 nt 0.4704
NM_001349547.2 NCBI
AGAGUGCCGAGCGCGCCGCAGCCAGCGGGCAGAUCCCAUCGUGUCCACA… 8729 nt 0.4557
NM_015071.6 NCBI
AGACACCGGCGGGGCGGCCGAGGCUGCUGUGAGAGGGCGCUCGAGGCUG… 9395 nt 0.4708
Summary

Interaction of a cell with the extracellular matrix triggers integrin cell surface receptors to begin signaling cascades that regulate the organization of the actin-cytoskeleton. One of the proteins involved in these cascades is focal adhesion kinase. The protein encoded by this gene is a GTPase activating protein that binds to focal adhesion kinase and mediates the activity of the GTP binding proteins RhoA and Cdc42. Defects in this gene are a cause of juvenile myelomonocytic leukemia (JMML). Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2017]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the ARHGAP26 is a venous blood-specific mRNA marker with exceptionally high sensitivity for body fluid identification, showing robust detection at 20 ng RNA input and stable, reliable amplification from 13–16-year-old blood stains from both large and small stains [Zhiyong Liu et al. DOI:10.1007/s00414-025-03434-0][Zubakov et al. DOI:10.1007/s00414-008-0249-z]. The integrated mRNA-cSNP panel enabled simultaneous body fluid identification and individualization, with the ARHGAP26 functioning as part of this dual-purpose forensic system.