Basic Information

Symbol
NCF2
RNA class
mRNA
Alias
Neutrophil Cytosolic Factor 2 NOXA2 NADPH Oxidase Activator 2 P67phox Neutrophil Cytosolic Factor 2 (65kD, Chronic Granulomatous Disease, Autosomal 2) Chronic Granulomatous Disease, Autosomal 2 Neutrophil NADPH Oxidase Factor 2 67 KDa Neutrophil Oxidase Factor Neutrophil Cytosol Factor 2 NCF-2 P67-PHOX P67-Phox P67PHOX
Location (GRCh38)
1:183554461-183593499
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000433.4
Sequence length
2267.0 nt
GC content
0.4914

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-738.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -784.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 601.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000433.4 NCBI
AUUCUACUCAUCUGGCCCAGAAAGUGAACACCUUGGGGGCCACUAAGGC… 2267 nt 0.4914
NM_001127651.3 NCBI
CUCACUCUAGGUCACGGGUUUCAUUUGGGACCAGUAGCCUAGUCUUUCA… 2242 nt 0.4880
NM_001190789.2 NCBI
AUUCUACUCAUCUGGCCCAGAAAGUGAACACCUUGGGGGCCACUAAGGC… 2024 nt 0.4926
NM_001190794.2 NCBI
AUUCUACUCAUCUGGCCCAGAAAGUGAACACCUUGGGGGCCACUAAGGC… 2132 nt 0.4944
NM_001410895.1 NCBI
CUCACUCUAGGUCACGGGUUUCAUUUGGGACCAGUAGCCUAGUCUUUCA… 2134 nt 0.4859
Summary

This gene encodes neutrophil cytosolic factor 2, the 67-kilodalton cytosolic subunit of the multi-protein NADPH oxidase complex found in neutrophils. This oxidase produces a burst of superoxide which is delivered to the lumen of the neutrophil phagosome. Mutations in this gene, as well as in other NADPH oxidase subunits, can result in chronic granulomatous disease, a disease that causes recurrent infections by catalase-positive organisms. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jun 2010]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the NCF2 gene showed significant upregulation with a fold change greater than 4 at 1, 4, and 7 days after a contusive spinal cord injury, as identified by RNA sequencing [Li et al. DOI:10.4103/1673-5374.255994].