Basic Information

Symbol
NCK1
RNA class
mRNA
Alias
NCK Adaptor Protein 1 NCKalpha NCK SH2/SH3 Adapter Protein NCK-Alpha SH2/SH3 Adapter Protein NCK1 Cytoplasmic Protein NCK1 NCK Adapter Protein 1 Nck-1 Non-Catalytic Region Of Tyrosine Kinase SH2/SH3 Adaptor Protein NCK-Alpha Melanoma NCK Protein NCK Tyrosine Kinase
Location (GRCh38)
3:136862177-136951606
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001291999.2
Sequence length
4451.0 nt
GC content
0.3597

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1098.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1190.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1069.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001190796.3 NCBI
ACUGAGAAUUAUCCUGAGCUGUGUUAACAAACUGACAGAACACAGAAUU… 4154 nt 0.3421
NM_001291999.2 NCBI
ACCGCGCGUGCCCCGCCUCUCUCCCAAGAGCUACGCGGCGGCGGCGGAG… 4451 nt 0.3597
NM_006153.6 NCBI
ACCGCGCGUGCCCCGCCUCUCUCCCAAGAGCUACGCGGCGGCGGCGGAG… 4417 nt 0.3568
Summary

The protein encoded by this gene is one of the signaling and transforming proteins containing Src homology 2 and 3 (SH2 and SH3) domains. It is located in the cytoplasm and is an adaptor protein involved in transducing signals from receptor tyrosine kinases to downstream signal recipients such as RAS. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found. [provided by RefSeq, Jun 2010]

Forensic Context

A study in human forensic autopsy cases using RNA sequencing demonstrated that the NCK1 was upregulated as a downstream mediator in the T cell receptor signaling pathway in a case of fatal anaphylactic shock [Nakao et al. DOI:10.1016/j.legalmed.2025.102772].