Basic Information

Symbol
NCL
RNA class
mRNA
Alias
Nucleolin Nsr1 C23 Protein C23
Location (GRCh38)
2:231453531-231483641
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005381.3
Sequence length
3924.0 nt
GC content
0.4671

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1205.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1277.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 892.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005381.3 NCBI
AGUCUCGAGCUCUCGCUGGCCUUCGGGUGUACGUGCUCCGGGAUCUUCA… 3924 nt 0.4671
Summary

Nucleolin (NCL), a eukaryotic nucleolar phosphoprotein, is involved in the synthesis and maturation of ribosomes. It is located mainly in dense fibrillar regions of the nucleolus. Human NCL gene consists of 14 exons with 13 introns and spans approximately 11kb. The intron 11 of the NCL gene encodes a small nucleolar RNA, termed U20. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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