Basic Information

Symbol
NCR3
RNA class
mRNA
Alias
Natural Cytotoxicity Triggering Receptor 3 NKp30 1C7 CD337 LY117 Natural Killer Cell P30-Related Protein Activating Natural Killer Receptor P30 Lymphocyte Antigen 117 NK-P30 Activating NK-A1 Receptor CD337 Antigen MALS
Location (GRCh38)
6:31588895-31593217
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_147130.3
Sequence length
1063.0 nt
GC content
0.5833

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-421.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -438.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 221.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145466.2 NCBI
CUCACACGCUUAGCUAGCCUGCCACAAGCUGGCCCCUUGGCCUCCUAGA… 1118 nt 0.5796
NM_001145467.2 NCBI
CUCACACGCUUAGCUAGCCUGCCACAAGCUGGCCCCUUGGCCUCCUAGA… 898 nt 0.5835
NM_147130.3 NCBI
CUCACACGCUUAGCUAGCCUGCCACAAGCUGGCCCCUUGGCCUCCUAGA… 1063 nt 0.5833
Summary

The protein encoded by this gene is a natural cytotoxicity receptor (NCR) that may aid NK cells in the lysis of tumor cells. The encoded protein interacts with CD3-zeta (CD247), a T-cell receptor. A single nucleotide polymorphism in the 5' untranslated region of this gene has been associated with mild malaria suceptibility. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, May 2010]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the NCR3 was highly expressed in the T7 and T8 T cell subpopulations identified via single-cell RNA sequencing in a patient following a radiation accident [Yan et al. DOI:10.3892/etm.2025.12846]. Another human study identified the NCR3 as a marker for mucosal-associated invariant T (MAIT) cells in the peripheral immune landscape of elderly hip fracture patients [Lu et al. DOI:10.1186/s12979-023-00380-6].