Basic Information

Symbol
NDP
RNA class
mRNA
Alias
Norrin Cystine Knot Growth Factor NDP Norrin EVR2 X-Linked Exudative Vitreoretinopathy 2 Protein Norrie Disease (Pseudoglioma) Norrie Disease Protein Exudative Vitreoretinopathy 2 (X-Linked) NDP, Norrin Cystine Knot Growth Factor FEVR ND
Location (GRCh38)
X:43948772-43973395
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000266.4
Sequence length
1719.0 nt
GC content
0.4503

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-502.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -537.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 499.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000266.4 NCBI
AGAAGAACAAAAGCAUUUGGAAGUAACAGGACCUCUUUCUAGCUCUCAG… 1719 nt 0.4503
Summary

This gene encodes a secreted protein with a cystein-knot motif that activates the Wnt/beta-catenin pathway. The protein forms disulfide-linked oligomers in the extracellular matrix. Mutations in this gene result in Norrie disease and X-linked exudative vitreoretinopathy. [provided by RefSeq, Feb 2009]

Forensic Context

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