Basic Information

Symbol
NDRG4
RNA class
mRNA
Alias
NDRG Family Member 4 SMAP-8 KIAA1180 Vascular Smooth Muscle Cell-Associated Protein 8 N-Myc Downstream-Regulated Gene 4 Protein Brain Development-Related Molecule 1 Protein NDRG4 BDM1 Smooth Muscle-Associated Protein 8 SMAP8
Location (GRCh38)
16:58462846-58513628
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001242835.2
Sequence length
3208.0 nt
GC content
0.5577

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1243.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1302.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 813.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130487.2 NCBI
AGAGCGCUCCUGGCUGUGAGCUGCUCCUGCCGCUUCGCUCCGCGCUCUC… 3368 nt 0.5698
NM_001242833.2 NCBI
ACAGAGCCGACCAUCUCCCACUCGAGCUGCCCCCGCCCUCUGGACCCGA… 3259 nt 0.5618
NM_001242834.2 NCBI
ACAGAGCCGACCAUCUCCCACUCGAGCUGCCCCCGCCCUCUGGACCCGA… 3223 nt 0.5591
NM_001242835.2 NCBI
ACAGAGCCGACCAUCUCCCACUCGAGCUGCCCCCGCCCUCUGGACCCGA… 3208 nt 0.5577
NM_001242836.2 NCBI
ACAGAGCCGACCAUCUCCCACUCGAGCUGCCCCCGCCCUCUGGACCCGA… 3169 nt 0.5576
NM_001363869.2 NCBI
AGAGCGCUCCUGGCUGUGAGCUGCUCCUGCCGCUUCGCUCCGCGCUCUC… 3460 nt 0.5714
NM_001378332.1 NCBI
AGAGCGCUCCUGGCUGUGAGCUGCUCCUGCCGCUUCGCUCCGCGCUCUC… 3497 nt 0.5733
NM_001378333.1 NCBI
AGAGCGCUCCUGGCUGUGAGCUGCUCCUGCCGCUUCGCUCCGCGCUCUC… 3461 nt 0.5709
NM_001378334.1 NCBI
AGAGCGCUCCUGGCUGUGAGCUGCUCCUGCCGCUUCGCUCCGCGCUCUC… 3458 nt 0.5735
NM_001378335.1 NCBI
AGAGCGCUCCUGGCUGUGAGCUGCUCCUGCCGCUUCGCUCCGCGCUCUC… 3422 nt 0.5710
Showing 1 to 10 of 24 entries
Summary

This gene is a member of the N-myc downregulated gene family which belongs to the alpha/beta hydrolase superfamily. The protein encoded by this gene is a cytoplasmic protein that is required for cell cycle progression and survival in primary astrocytes and may be involved in the regulation of mitogenic signalling in vascular smooth muscles cells. Alternative splicing results in multiple transcripts encoding different isoforms.[provided by RefSeq, Jun 2011]

Forensic Context

A study in mice and rats demonstrated that N-myc downstream-regulated gene 4 (Ndrg4) is a target of the NDRG4 and miR-34c-5p, with its expression being negatively correlated with the NDRG4 in myocardial tissues following acute myocardial infarction [Tuerxun et al. DOI:10.1007/s12013-024-01528-x].