Basic Information

Symbol
NDRG4
RNA class
mRNA
Alias
NDRG Family Member 4 SMAP-8 KIAA1180 Vascular Smooth Muscle Cell-Associated Protein 8 N-Myc Downstream-Regulated Gene 4 Protein Brain Development-Related Molecule 1 Protein NDRG4 BDM1 Smooth Muscle-Associated Protein 8 SMAP8
Location (GRCh38)
16:58462846-58513628
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001242835.2
Sequence length
3208.0 nt
GC content
0.5577

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1243.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1302.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 813.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001378336.1 NCBI
AGAGCGCUCCUGGCUGUGAGCUGCUCCUGCCGCUUCGCUCCGCGCUCUC… 3407 nt 0.5697
NM_001378337.1 NCBI
AGUGACUUCUGUGUUCUCCCCGGUGUGGAGAGACCCAGACAGGAGGAAA… 3362 nt 0.5592
NM_001378338.1 NCBI
GGCUGCCCGCACCUGCACCCGCGCGUCGGCGGCGCCGAAGCCCCGCUCC… 3358 nt 0.5661
NM_001378339.1 NCBI
GGCUGCCCGCACCUGCACCCGCGCGUCGGCGGCGCCGAAGCCCCGCUCC… 3355 nt 0.5687
NM_001378340.1 NCBI
GGACCCGUGGGCUUCUGGCAGGACCCGCGCCAUGGACCUCUUAUUUCUG… 3543 nt 0.5662
NM_001378341.1 NCBI
AGUGACUUCUGUGUUCUCCCCGGUGUGGAGAGACCCAGACAGGAGGAAA… 3347 nt 0.5578
NM_001378342.1 NCBI
GGCUGCCCGCACCUGCACCCGCGCGUCGGCGGCGCCGAAGCCCCGCUCC… 3319 nt 0.5661
NM_001378343.1 NCBI
AGUGACUUCUGUGUUCUCCCCGGUGUGGAGAGACCCAGACAGGAGGAAA… 3308 nt 0.5577
NM_001378344.1 NCBI
ACAGAGCCGACCAUCUCCCACUCGAGCUGCCCCCGCCCUCUGGACCCGA… 3298 nt 0.5619
NM_001378345.1 NCBI
GGCUGCCCGCACCUGCACCCGCGCGUCGGCGGCGCCGAAGCCCCGCUCC… 3304 nt 0.5648
Showing 11 to 20 of 24 entries
Summary

This gene is a member of the N-myc downregulated gene family which belongs to the alpha/beta hydrolase superfamily. The protein encoded by this gene is a cytoplasmic protein that is required for cell cycle progression and survival in primary astrocytes and may be involved in the regulation of mitogenic signalling in vascular smooth muscles cells. Alternative splicing results in multiple transcripts encoding different isoforms.[provided by RefSeq, Jun 2011]

Forensic Context

A study in mice and rats demonstrated that N-myc downstream-regulated gene 4 (Ndrg4) is a target of the NDRG4 and miR-34c-5p, with its expression being negatively correlated with the NDRG4 in myocardial tissues following acute myocardial infarction [Tuerxun et al. DOI:10.1007/s12013-024-01528-x].